Ústav botaniky a zoologie je součástí Přírodovědecké fakulty Masarykovy univerzity a vznikl v roce 2006 sloučením katedry botaniky a katedry zoologie a ekologie.

Ústav zajišťuje výuku základních předmětů v bakalářském studijním programu Biologie, magisterském studijním programu Biologie, oborech Systematická biologie a ekologie a Učitelství biologie pro střední školy, doktorském studijním programu Biologie, oborech Botanika, Ekologie, Hydrobiologie, Parazitologie a Zoologie.

Ústav botaniky a zoologie

Základní vyučované předměty pokrývají problematiku systematiky a evoluce organismů, ekologie, biogeografie, metodiky různých biologických a ekologických disciplín a didaktiku biologie. Do výuky jsou zapojeni i externí učitelé z Akademie věd ČR a dalších vysokých škol. Nedílnou součástí výuky jsou determinační praktika a terénní cvičení v České republice i v zahraničí. Jako vodítko pro průchod bakalářským a magisterským studiem slouží rozdělení studia do specializačních modulů podle zaměření studentů, viz portál Modularizace výuky evoluční a ekologické biologie.

Výzkumné aktivity ústavu se profilují v těchto oborech:

Biosystematika cévnatých rostlin
http://www.sci.muni.cz/botany/systemgr/ - dosavadní výzkum byl soustředěn hlavně na zpracování vybraných rodů české flóry pro monografické kompendium Květena České republiky. V současné době se rozvíjí zejména biosystematické studium vybraných rodů v širším území střední Evropy, zejména u čeledí Asteraceae (hvězdnicovité), Poaceae (trávy) a Cyperaceae (šáchorovité). Jako servisní pracoviště biosystematického výzkumu funguje na katedře karyologická laboratoř, laboratoř molekulární taxonomie rostlin a laboratoř průtokové cytometrie. Významným zdrojem materiálu pro taxonomické studie je herbář Ústavu botaniky a zoologie (BRNU), obsahující cca 560 000 položek.

Výzkum vegetace
http://www.sci.muni.cz/botany/vegsci/index.php?lang=cz - hlavním cílem současného výzkumu je (1) zpracování formalizované klasifikace vegetačních typů České republiky, v návaznosti na mezinárodní projekty European Vegetation Survey a SynBioSys Europe, (2) vývoj a testování nových metod analýzy dat z velkých fytocenologických databází a (3) studium diverzity vegetace na úrovni krajiny, se zvláštním zaměřením na oblast střední Evropy a jižní Sibiře. Na pracovišti je koordinována Česká národní fytocenologická databáze.

Ekologie rašelinišť
http://www.sci.muni.cz/botany/mirecol/index.php?lang=cz - současný výzkum je zaměřen na vztah druhového složení vegetace k faktorům prostředí: k chemismu vody, přístupnosti živin, vodnímu režimu a dlouhodobým změnám způsobeným lidskou činností ve střední Evropě. Zaměřujeme se také na vztahy mezi společenstvy vyšších rostlin a ostatních taxonomických skupin (řasy, bezobratlí). Ve výzkumu je kladen důraz na širokou geografickou a prostorovou škálu. Stejné pracovní metody jsou používány v rozdílných makroklimatických, geologických a geografických oblastech (střední Evropa, Karpaty, Balkán).

Terestričtí bezobratlí
http://www.sci.muni.cz/zoolecol/inverteb - členové výzkumného týmu studují různé aspekty zoologie a ekologie suchozemských bezobratlých živočichů. Od druhé poloviny 90. let bylo hlavní úsilí soustředěno na výzkum bezobratlých živočichů na území Biosférické rezervace Pálava. V současné době jsou podobnou metodikou sledovány vybrané skupiny bezobratlých v Národním parku Podyjí. Výzkumný tým dlouhodobě zajišťuje organizaci ekologického a biosystematického výzkumu řádu dvoukřídlých. Bylo vybudováno národní referenční centrum, které se zabývá shromažďováním publikovaných dat, přípravou národních bibliografií a faunistických seznamů. Druhou zájmovou oblastí je výzkum dekompozitorů zapojených v půdních potravních řetězcích a v rozkládajícím se dřevě. Třetí oblastí výzkumu je etologie pavouků se zřetelem na predátory mravenců.

Hydrobiologie
http://www.sci.muni.cz/zoolecol/hydrobio - členové hydrobiologického týmu se v současnosti zabývají několika směry výzkumu: - vývojové cykly a životní strategie druhů, biodiverzita ekosystémů tekoucích vod, fauna hyporeálu a podzemních vod, - vliv průtokových režimů na biotu dna, - primární produkce a diverzita společenstva řas tekoucích vod, - biomonitoring stavu toků a kvality vod, - vlivy regulací na říční ekosystém a jeho revitalizace, - perzistentní polutanty v říčních ekosystémech a hodnocení ekologických rizik.

Vertebratologie
http://www.sci.muni.cz/zoolecol/verteb Oddělení se specializují hlavně na výzkum ekologie netopýrů. Zaměření na studium savců z řádu Chiroptera se rozvíjí od roku 1969, kdy na katedru přišel J. Gaisler, jeden ze dvou zakladatelů moderní české chiropterologie. Od roku 1989 se do výzkumu netopýrů zapojil Z. Řehák. Od počátku probíhal výzkum na katedře v těsné spolupráci s dnešním Ústavem biologie obratlovců AV ČR. Netopýři byli a jsou tématem četných diplomových a doktorských dizertačních prací.

Parazitologie
http://www.sci.muni.cz/zoolecol/parasit/parasitology.htm - tým se soustřeďuje na výzkum v těchto oblastech: - morfologie, taxonomie, biologie a rozšíření monogeneí parazitujících na rybách; diverzita parazitických monogeneí; ekologie populací a společenstev parazitů ryb, zvláště monogeneí; evoluční ekologie parazitů ryb, analýza diverzity u různých "parazit - hostitel" systémů ve vztahu k podmínkám prostředí; neurobiologie, struktura povrchu a topografie modelových druhů parazitů.

Výzkum je veden ve výše uvedených oborech a je hrazen převážně z grantových prostředků a prostředků výzkumného záměru.

Ústav je součástí Centra aplikované ekologie rostlin, společného pracoviště Masarykovy univerzity v Brně a Botanického ústavu AV ČR, pracoviště Brno, založeného v roce 2002.