Aktuálně v jarním semestru 2012

ZBRUSU NOVÉ PŘEDMĚTY

BAKALÁŘSKÉ STUDIUM

Speciální histologie živočichů

Bi4280, vede Iveta Hodová
doporučený předmět pro 2.–3. ročník bakalářského studia zoologie

Nový předmět navazuje na základní přednášku Histologie a organologie, doplňuje a rozšiřuje její obsah:
• seznámení se základy histologických metod (příprava vzorků, barvicí metody),
• charakteristiky konkrétních tkání (epitely, pojiva, svaly, nervy, tělní tekutiny a oběhová soustava, dýchací, trávicí, vylučovací a reprodukční soustava, smyslové orgány) a jejich výskyt v živočišném organismu,
• charakteristiky tělních systémů a jejich srovnání u vybraných bezobratlých a obratlovců.
Poznání konkrétních tkání a metod jejich preparace a barvení v souběžném cvičení.

MAGISTERSKÉ STUDIUM

Terénní cvičení z arachnologie

Bi8057, vedou Stanislav Pekár a Milan Řezáč
doporučený předmět pro libovolný ročník magisterského studia zoologie bezobratlých, speciálně arachnologického zaměření

Sedmidenní kurz navazuje na teoretickou výuku předmětu Arachnologie. Cílem cvičení je naučit studenty realizovat teoretické znalosti v řešení arachnologických výzkum-ných projektů. V průběhu kurzu budou studenti pracovat na projektech, tj. navrhnou design studie, nashromáždí data, vyhodnotí je a nakonec veřejně obhájí. K řešení projektů budou používat standardní sběratelské a analytické metody.
Cvičení je dobrovolné pro absolventy kurzu Arachnologie (studenty magisterského studia, otevřené je i pro doktorandy). Jako didaktická pomůcka bude vytvořené skriptum; determinaci ulehčí srovnávací sbírka pavouků.

Determinace vodních bezobratlých - cvičení

Bi8762, vede Jana Schenková a spolupracovníci
doporučený předmět pro libovolný ročník magisterského studia zoologie bezobratlých a hydrobiologie

Předmět vzniklý rozdělením dosavadního determinačního cvičení z bezobratlých. Rozšířené pojetí předmětu umožní postihnout víc skupin do hlubší úrovně poznání.

Cvičení zaměřené na vodní bezobratlé naučí determinovat zástupce ekologicky a bioindikačně významných skupin vodních živočichů: "Oligochaeta", Hirudinida, "Crustacea", Ephemeroptera, Odonata, Plecoptera, Trichoptera, Coleoptera, Heteroptera, Diptera – Chironomidae, Simuliidae.

Determinace suchozemských bezobratlých - cvičení

Bi8763, vede Jiří Schlaghamerský a spolupracovníci
doporučený předmět pro libovolný ročník magisterského studia zoologie bezobratlých, speciálně zaměření entomologie, zoologie bezobratlých (malakozoologie, arachnologie) a půdní biologie

Předmět vzniklý rozdělením dosavadního determinačního cvičení z bezobratlých. Rozšířené pojetí předmětu umožní postihnout víc skupin do hlubší úrovně poznání. Absolventům druhého kurzu nebude cizí determinace suchozemských zástupců významných skupin, jako jsou: Annelida: Lumbricidae, Enchytraeidae; Gastropoda; Isopoda, Diplopoda, Chilopoda, Opiliones, Araneae (vybrané čeledi), Heteroptera, Cicadomorpha, Caelifera, Ensifera, Formicidae, Coleoptera (vybrané čeledi).

Znečišťování vod a ekologie technických zásahů

Bi8040, přednáší Jan Helešic
doporučený předmět pro libovolný ročník magisterského studia hydrobiologie

Nový předmět seznamující se základními poznatky a problémy vyplývajícími z technických zásahů (regulací) v řekách a stojatých vodách, celých povodí. Velká část kurzu je věnována znečišťování vod. Kurz je založen na teoretických základech s uvedením aktuálních příkladů z ČR a celého světa. Jsou rozebírány dopady na ekosystémy a reakce organismů, populací a společenstev. Nedílnou součástí jsou teoretická a praktická východiska k restauraci a revitalizaci recipientů a celých povodí. Studenti tak získají informace k porozumění vlivu lidské činnosti na přírodní procesy ve vodním prostředí.

Čistírenství a vodárenství

Bi8045, přednáší Jan Helešic
doporučený předmět pro libovolný ročník magisterského studia hydrobiologie

Druhý nový předmět přiblíží biotechnologické postupy využívané v čistírenství a vodárenství. Je uveden i stručný přehled technických postupů, fyzikálního a chemického čištění vod. Kurz má za úkol připravit studenty pro praxi, tak aby získali základní přehled v oboru technické hydrobiologie.

Chráněná území Brna a okolí 2

Bi6682, vede Pavel Veselý
volitelný předmět pro libovolný ročník bakalářského i magisterského studia

Nově zaváděný předmět, doplňující Chráněná území ČR (zabývající se zejména velkoplošnými územími v celostátním měřítku) o přehled maloplošných chráněných území jižní Moravy. Podrobné poznání místně cenných lokalit v oblasti, kde je na relativně malém celkovém území soustředěno široké spektrum biotopů se značnou diverzitou rostlinných a živočišných společenstev, a problematiky jejich ochrany.

Na úspěch prvního dílu navazují Chráněná území Brna a okolí 2, tentokrát i dále od moravské metropole (Švařec, Řeka, Ransko, ...). Materiály k exkurzním cílům čekejte během jara na http://sci.muni.cz/~pvesely/vyuka/.

INOVOVANÉ A ČÍM DÁL LEPŠÍ PŘEDMĚTY

BOTANIKA

Vybrané problémy z botaniky

Bi0662, garant Milan Chytrý
volitelný předmět pro libovolný ročník bakalářského i magisterského studia

Proč je obecně důležité studovat procesy v půdě a proč se pozornost současného výzkumu soustřeďuje na severské ekosystémy? Prof. Hana Šantrůčková z Jihočeské univerzity představí koloběh uhlíku v tundře, specifika severských půd a co mohou přinést změny klimatu – co už o dané problematice víme a jakým směrem zaměřit výzkum, jakými metodami a přístupy.
Dr. Nikolaj Laščinskij z Ruské akademie věd v Novosibirsku naváže blokem Ecosystems of Southern Siberia (Southern tundra in Western Siberia • Spatial structure of vegetation in southern tundra: insights from remote sensing • Subtaiga and forest-steppe of Western Siberia: a unique Siberian landscape • Black taiga: a remarkable Siberian ecosystem).
Bloková výuka, předpokládaný termín 9.–10. března.

Blok botanických expertů

Bi0672, garanti Milan Chytrý a Petr Bureš
volitelný předmět pro libovolný ročník bakalářského i magisterského studia

Zahraniční botanická exkurze

Bi6691, vedou Milan Chytrý a Vít Grulich
povinně volitelný předmět pro libovolný ročník bakalářského i magisterského studia

Tradiční sedmidenní exkurze v roce 2012 zavítá skoro na "střechu Evropy" – cílem jsou švýcarské Alpy. Když u nás léto vládne a zem se stává vyprahlou, mezi alpskými štíty je vegetace v plném rozpuku – kdo chce vidět na vlastní oči, ať si pro tento rok rezervuje poslední týden v srpnu. Více v průběhu jara, těšte se!

Terénní cvičení z geobotaniky

Bi6661, vedou David Zelený a Lubomír Tichý
povinně volitelný předmět, podle zaměření vhodný pro 2.–3. ročník bakalářského nebo 1. ročník magisterského studia

Sběr dat o vegetaci, vegetační snímkování • Měření a vyhodnocení abiotických faktorů (teplota, pH) • Srovnání získaných dat podél topografického gradientu v říčním údolí • Biotopové mapování, zpracování vegetačních map • Výzkum travinné vegetace • Měření biomasy, vlhkosti a hloubky půdy • To vše s využitím nové přístrojové techniky, individuální úkoly, prezentace vlastních výsledků.
Bloková výuka v druhé polovině května.

Bryologické praktikum

Bi6640, vede Svatava Kubešová
povinně volitelný předmět, doporučený pro 1. ročník magisterského studia

Z minulého roku známé "domalovánky" mechorostů – obrazový materiál s potřebou doplnění struktur, kde se nacházejí určovací znaky, podle vlastního pozorování. Aktivně vyhledat na demonstrovaném materiálu důležité rozlišovací znaky, pozorovat a umět zakreslit, to je hlavní motivace bryologického praktika. Letos s revidovanými vzorky rašeliníků a novými vzorky mokřadních, horských a suchomilných skalních mechorostů z Moravského krasu, Krkonoš či Nízkých Tater.

Ekologie a význam hub

Bi7535, přednáší Petr Hrouda
volitelný předmět pro libovolný ročník bakalářského nebo magisterského studia, určený pro zaměření mykologie

Životní strategie hub, saprotrofie, symbiotické vztahy i parazitismus, houby v různých biotopech, jejich šíření, ohrožení i ochrana ve stále doplňované přednášce, která v závěru představí houby jedlé i jedovaté, člověkem využívané i škodlivé.

ZOOLOGIE

Terénní cvičení z entomologie

Bi0055, vedou Michal Horsák, Igor Malenovský a Petr Kment
doporučený předmět pro 2. a 3. ročník bakalářského a libovolný ročník magisterského studia

Blokové terénní cvičení představí hmyz rozmanitých biotopů – společenstva skalních vápencových stepí, teplých nížinných lesů, měkkých a tvrdých lužních lesů, halofilních stanovišť, mokřadních luk a rákosin i říčního koryta. Praktické ukázky odlovu hmyzu s denní i noční aktivitou, monitoring zástupců konkrétních skupin.
Navazující laboratorní část s praktickou výukou preparace jednotlivých skupin hmyzu, demonstrace základních znaků tělní morfologie a prohloubení schopnosti determinace konkrétních taxonů. Závěrečná sumarizace formou vlastních prezentací studentů k jednotlivým pozorovaným skupinám.

Pokroky ve výzkumu obratlovců

Bi4001, garanti Zdeněk Řehák a Josef Bryja
povinně volitelný předmět pro 3. ročník bakalářského a magisterské studium, povinný pro studenty vertebratologie

Specializační seminář, připravovaný ve spolupráci ÚBZ PřF MU s Ústavem biologie obratlovců AV ČR, uvádí i v jarním semestru:
• diskuze nad současným výzkumem pedagogů a studentů vertebratologie;
• zapojení významných odborníků z jiných pracovišť, prezentujících referáty o výsledcích vlastních výzkumů.
Příspěvky specialistů tradičně v rozsahu několika přednášek během semestru.

EKOLOGICKÉ PŘEDMĚTY

Bioindikace a hodnocení ekologického stavu povrchových vod

Bi7007, vedou Světlana Zahrádková a Vít Grulich
volitelný předmět pro libovolný ročník magisterského studia botaniky i zoologie

Principy bioindikace ve vodním prostředí, používané metody a jejich aplikace v programech monitoringu ekologického stavu povrchových vod v evropských podmínkách se speciálním zaměřením na ČR. Pozornost je věnována různým složkám bioty využívaným při monitoringu povrchových vod tekoucích i stojatých s důrazem na teoretické i praktické aspekty.

Zásadní inovací předmětu je rozšíření o cvičení ve 3 blocích – dva terénní dny v jarním a jeden den v jaroletním období budou věnovány praktickému procvičení vybraných metod odběru vzorků. Další blok (jeden den) proběhne v počítačové učebně, zde budou počítány modelové příklady hodnocení ekologického stavu jednotlivých biologických složek a sumární hodnocení.

Ekosystém tropického pralesa

Bi8009, přednáší Ivona Foitová
volitelný předmět pro libovolný ročník bakalářského i magisterského studia

Předmět představuje biologickou rozmanitost pralesních ekosystémů, jejich typy a struktury, dynamiku tropických pralesů a ohrožené zástupce tohoto druhově bohatého biomu. Zvláštní zřetel je věnován pralesům indomalajské oblasti, zejména Sumatry a Kalimantanu, a metodologii terénní práce v tamějších lokalitách (v návaz-nosti na výzkumné aktivity, do kterých se absolventi mohou výhledově zapojit).
Náplň předmětu je zaměřena i na problematiku proměn a narušení ekosystému (ochrana, těžba), možnosti dlouhodobé strategie a zapojení místní komunity. Nově je doplněna část zaměřená na léčivé prostředky tropického pralesa (přírodní produkty a medicína, význam léčivých rostlin v tradiční indonéské medicíně, etnofarmakologie), výzkum a ochranu tropických rostlin (léčivé rostliny v potravním spektru, možné speciální chování vedoucí k uzdravení u velkých primátů).

Ekologie moří a oceánobiologie + cvičení

Bi8095, Bi8095c, vedou Jan Helešic a Marie Zhai
volitelné předměty pro libovolný ročník bakalářského i magisterského studia, doporučené pro studenty hydrobiologie

Zásadní změna v pojetí části přednášky, věnované základnímu přehledu mořských organizmů. Nikoli jednotlivé organizmy podle systému, ale přehled typických společenstev uspořádaných do tematických celků, ze kterých jsou dobře zřejmé ekologické souvislosti.

Zvláštní pozornost je věnována fauně Středozemního moře, kterou mají studenti možnost sami pozorovat na praktickém kurzu mořské biologie pořádaném Karlovou univerzitou v srpnu či září každého roku. Účast na tomto kurzu je studentům MU umožněna v rámci předmětu Ekologie moří a oceánobiologie - cvičení.

Ekologie mokřadů + cvičení

Bi8165, Bi8169, vede Kateřina Šumberová
volitelné předměty pro libovolný ročník bakalářského i magisterského studia, doporučené pro studenty ekologie rostlin

Rozšíření rozsahu terénního cvičení – obohacená exkurze vhodně doplní poznatky z přednášky o ekologii mokřadních biotopů a možnostech jejich ochrany. Předpokládána je v jarním období (květen) jednodenní výprava v okolí Brna a v letní sezóně (srpen) čtyřdenní exkurze do vybrané mokřadní oblasti České republiky s praktickými ukázkami různých typů mokřadů a mokřadních druhů rostlin a živočichů. Též ukázky vlivu člověka na mokřadní biotopy a diskuse nad možností ochrany lokalit a osvojení praktických dovedností pro vlastní terénní výzkum.
Na vybraných lokalitách samostatná výzkumná práce studentů v malých skupinách.

Molekulární ekologie

Bi0999, vedou Josef Bryja a Miloš Macholán
doporučený předmět pro 1. ročník magisterského studia zoologie

Návaznost a tematické napojení na Genetické metody v zoologii. Inovované přednášky věnované mimo jiné hybridizaci a roli hybridních zón; teorii koalescence; fytogeografii a genetické historii rozšíření druhu; fylogenetické analýze, rekonstrukci fylogeneze; využití genetických metod v behaviorální ekologii; stanovení populačně-genetické struktury; ochranářské genetice (inbreeding, efektivní velikost populace, "genetic rescue"); funkční genetické variabilitě a jejímu významu pro adaptace.

Chráněná území ČR 1

Bi8881, přednáší Jan Roleček
volitelný předmět pro libovolný ročník bakalářského i magisterského studia

Aktuální přednášky, seznamující s tematikou ochrany přírody ve velkoplošných chráněných územích České republiky. Přírodní podmínky území, flóra, vegetace a fauna, jakož i další hlediska se snahou o syntézu na krajinné úrovni.
Letos opět první ze dvou částí, alternujících v dvouletém cyklu: KRNAP, NP Podyjí, CHKO a BR Pálava-Dolní Morava, Bílé Karpaty, CHKO Beskydy, Broumovsko, Jeseníky, Litovelské Pomoraví, Moravský kras, Orlické hory, Poodří.

ICT PRO VŠECHNY

Statistické zpracování biosystematických a taxonomických dat

Bi6590, vede Petr Šmarda
volitelný předmět pro libovolný ročník magisterského studia

(1) zásadní rozšíření stávajícího cvičení (aktuálně v rozsahu 2/2) k vícerozměrným statistickým a fylogenetickým metodám v návaznosti na výuku ve cvičení z metod taxonomie rostlin;
(2) zaměření cvičení na praktické osvojení si teoretických znalostí získaných při výkladu samostatnou prací s jednotlivými statistickými programy a technikami na cvičeních;
(3) cíl naučit studenty samostatně a efektivně plánovat experimenty a vyhodno-covat je v souladu s  požadavky současných vědních disciplín a mezinárodních časopisů.
Nedílnou součástí výuky předmětu bude práce s programem Phylocom, v současné době široce využívaným při testování evoluce znaků v rámci fylogenetických studií.

Geografické informační systémy v botanice a zoologii

Bi9000, vede Ondřej Hájek
volitelný předmět pro libovolný ročník bakalářského i magisterského studia

Seznámení s GIS-ovými nástroji, orientace v souřadných systémech, prostorová a atributová složka dat, zvládnutí jednoduchých analýz, na závěr uplatnění nabytých znalostí v samostatném projektu – co se tady naučíš, v diplomce jako když najdeš...

Ani loňské rozšíření rozsahu na 1/2 časově nestačí na obohacení o všechna plánovaná nová cvičení (v oblasti programování a psaní skriptů a v oblasti tvorby webových mapových aplikací...) a proto dochází k dalšímu rozšíření: v jarním semestru máte před sebou GIS v botanice a zoologii I (1h předn./2h cvič.), na který v podzimním semestru naváže GIS v botanice a zoologii II (2h cvič.).

Pokročilé zpracování biologických dat

Bi7921, vede Stanislav Pekár
volitelný předmět pro libovolný ročník magisterského studia

Úvod do problematiky korelovaných dat, experimentální typy designů, definice replikace a pseudoreplikace • Metody odhadů koeficientů pevných a náhodých efektů, rozvoj zobecněného lineárního modelu • Linear Mixed Effect Models, definice modelu s náhodnými a smíšenými efekty, charakteristiky chyb, diagnostika předpokladů, kovarianční struktury • Analýza časových řad, prostorová analýza • Generalised Least Squares a Generalized Estimating Equations, definice modelů s pevnými efekty, charakteristiky chyb, diagnostika předpokladů, korelační struktury • Fylogenetické korekce.
Metody pokročilé analýzy dat, samostatné řešení konkrétních biologických příkladů.

BAKALÁŘSKÉ STUDIUM

Pedobiologie

Bi8001, přednáší Jiří Schlaghamerský
povinně volitelný předmět pro 3. ročník bakalářského studia zaměření Zoologie, základní předmět pro budoucí studenty magisterského studia půdní biologie

Základní otázky půdní biologie v celém rozsahu tohoto oboru: úvod do půdy jako životního prostředí organismů; význam půdy jako součásti suchozemských ekosystémů pro koloběh živin; funkce a diversita rozkladačů - saprotrofní potravní řetězce a sítě; fotoautotrofní organismy v půdě; funkce a diversita fytofágních půdních organismů a potravních sítí založených na fotoautotrofní produkci; přehled skupin půdních živočichů, jejich způsobu života a funkce; rozklad dřeva, trusu a mršin a zúčastněná společenstva organismů; základní metodika pedobiologických studií se zahrnutím nejnovějších trendů z hlediska řešené problematiky i užívaných metod.

Základy entomologie + cvičení

Bi6760, přednáší Jaromír Vaňhara, cvičení vede Andrea Tóthová
povinně volitelný předmět pro 3. ročník bakalářského studia zaměření Zoologie, základní předmět pro budoucí studenty magisterského studia entomologie

Aktuální poznatky v teoretické výuce, doplněné o nově zařazené cvičení (0/2):
Metody: pitva hmyzu, preparace genitálu u suchých exemplářů, preparace lihového materiálu drobných dvoukřídlých, způsoby fixace materiálu pro molekulární analýzy, preparace na sucho.
Morfologie a anatomie: hlava (ústní ústrojí, oči, tykadla), hruď (sklerity), končetiny, křídla (žilnatina, srovnání u různých řádů), zadeček, hypopygia samců, larvy, kukly.
Pobytové stopy hmyzu v přírodě, požerky, miny, hálky, stavby.
Systém, základní orientace, praktické poznávání.

Základní limnologické metody

Bi6750, vedou Petr Pařil a Jan Sychra
povinně volitelný předmět pro 3. ročník bakalářského studia zaměření Zoologie, základní předmět pro budoucí studenty magisterského studia hydrobiologie

Prezentace moderních, aktuálně používaných metod odběru a zpracování vzorků, hodnocení získaných dat. Rozšířené spektrum pomůcek a odběrových zařízení demonstrovaných během výuky v terénu i laboratoři. Praktická výuka s použitím materiálů představujících názorně jednotlivé přístroje a zařízení, metody a postupy.

Taxonomie rostlin, Metody rostlinné taxonomie

Bi6580, Bi6589, přednáší Petr Bureš a Petr Šmarda s přispěním Jakuba Šmerdy
povinně volitelné předměty pro 3. ročník bakalářského studia zaměření Botanika, základní předměty pro budoucí studenty magisterského studia biosystematiky rostlin

Klasická taxonomie studuje a interpretuje variabilitu rostlinných organizmů, základním předmětem studia jsou druhy a jejich populace. Inovovaná přednáška zahrne biosystematické aspekty, integrující taxonomický a evoluční přístup (procesy a zákonitosti spojené se vznikem taxonů: mezidruhová hybridizace, polyploidizace, adaptivní radiace – taxony samotné jako modely pro takové studium) se zařazením dosud málo využívaných přístupů ke studiu fenologie a květní biologie.

Ve cvičení seznámení s molekulárními, cytogenetickými a cytometrickými metodami využívanými v současném biosystematickém výzkumu: (i) metody izolace DNA; (ii) praktické řešení vybraných problému pomocí markerovacích systémů (PCR-RFLP, IRAP, REMAP, AFLP); (iii) kvantifikace transpozonů pomocí real time-PCR; (iv) spektrofotometrické metody studia genomu (reasociační kinetika a stanovení melting temperature); (v) sekvencování (cílové sekvence a jejich výběr, příprava sekvence pro sekvencování, sekvencování, zpracování sekvencí); (vi) cytometrické přístupy (stanovení stupně ploidie, absolutní velikosti DNA, AT/GC genom. poměru).

Systém a evoluce vyšších rostlin + cvičení

Bi2030, přednáší Petr Bureš, cvičení vedou Olga Rotreklová a Pavel Veselý
povinný předmět pro 1. ročník bakalářského studia Systematické biologie a ekologie a učitelských kombinací

Angiosperm Phylogeny Group – recentně uznávané uspořádání systému rostlin se snahou o maximální možné zjednodušení a oporu molekulárně-fylogenetického systému v pozorovatelných morfologických znacích prezentovaných na zástupcích středoevropské flóry, viz http://www.sci.muni.cz/botany/bures/vysrost/vysrost.htm.

Doprovodné praktické cvičení představí modelový materiál druhů charakteristických pro taxony vymezené v aktuálním uspořádání organismů, a to s přispěním vloni pořízených trvalých preparátů a výukového herbáře doplněného o nové položky.

Systém a evoluce obratlovců + cvičení

Bi2090, přednáší Zdeněk Řehák, cvičení vedou Tomáš Bartonička a Jan Sychra
povinný předmět pro 1. ročník bakalářského studia Systematické biologie a ekologie a učitelských kombinací

Zachycení moderních trendů v nahlížení na systém nižších strunatců a obratlovců, novinky ve fylogenetickém systému, aktuální dendrogramy, evoluční vztahy fosilních i recentních obratlovců.

Frekventanti cvičení se mohou těšit na doplněný a renovovaný fond vertebratologic-kých sbírek (vzoroví jedinci různých druhů) – preparáty lebek zalité do pryskyřice, osteologické a formaldehydové preparáty, balky různých velikostí, dermoplastické a sklolaminátové preparáty.

Terénní cvičení ze zoologie

Bi2140, vedou Jana Schenková, Jan Sychra a spol.
povinný předmět pro 1. ročník bakalářského studia Systematické biologie a ekologie a učitelských kombinací

Pět dní terénní praxe v Bransouzích, pro učitelské kombinace i pár dní kolem Brna s demonstrací nejrůznějších skupin bezobratlých i obratlovců. Obzory rozšířené novými dalekohledy a MP3 přehrávačem ptačích hlasů, přímo na terénní základně k dispozici mikroskop i preparační mikroskopy. Průběžně obohacovaná studijní sbírka vybraných druhů, postupně se rodí fotografická příručka zdejší fauny.