Publications
2025 | 2024 | 2023 | 2022 | 2021 | 2020 | 2019 | 2018 | 2017 | 2016 | 2015 | 2014 | 2013 | 2012 | 2011 | 2010 | 2009 | 2008 | 2007 | 2006 | 2005
Plant Systematics | Vegetation Research | Mire Ecology | Invertebrates Research
Parazitology | Hydrobiology | Vertebratology | Cryptogamology
Plant Systematics
2025
- Rosche C., Broennimann O., Novikov A., Mrázová V., Boiko G.V., Danihelka J., Gastner M.T., Guisan A., Kožić K., Lehnert M., Müller-Schärer H., Nagy D.U., Remelgado R., Ronikier M., Selke J.A., Shiyan N.M., Suchan T., Thoma A.E., Zdvořák P. & Mráz P. (2025): Herbarium specimens reveal a cryptic invasion of polyploid Centaurea stoebe in Europe New Phytologist 245: 392-405. - https://doi.org/10.1111/nph.20212
2024
- Ardenghi M.G.A., Šmarda P., Calbi M., Coppi A., Lastrucci L., Lazzaro L., Mugnai M., Quercioli C., Rossi G. & Foggi B. (2024): Revision of the Festuca marginata "group" (Festuca sect. Festuca, Poaceae) in Southern Europe, with special reference to France, Italy and Greece. Plant Biosystems 158: 1192-1214. - https://doi.org/10.1080/11263504.2024.2395870
- Bednarska I., Cwener A. & Šmarda P. (2024): Festuca makutrensis (Poaceae) in the flora of the Eastern Europe. Plant Systematics and Evolution 310: 33. - https://doi.org/10.1007/s00606-024-01913-2
- Bureš P. (2024): Eleocharis R. Br. - bahnička. In: Štěpánková J., Chrtek J. jun., Kaplan Z. (eds.). Květena České republiky = Flora of the Czech Republic. 9. Vydání první. Praha: Academia. Pp. 138-157.
- Bureš P. (2024): Trichophorum Pers. - suchopýrek. In: Štěpánková J., Chrtek J. jun., Kaplan Z. (eds.). Květena České republiky = Flora of the Czech Republic. 9. Vydání první. Praha: Academia. Pp. 111-114.
- Bureš P. & Danihelka J. (2024): Alopecurus L. - psárka In: Štěpánková J., Chrtek J. jun., Kaplan Z. (eds.). Květena České republiky = Flora of the Czech Republic. 9. Vydání první. Praha: Academia. Pp. 552-560.
- Bureš P., Del Guacchio E., Šmerda J., Özcan M., Blizňáková P., Vavrinec M., Michálková E., Veselý P., Veselá K. & Zedek F. (2024): Intergeneric hybrid origin of the invasive tetraploid Cirsium vulgare. Plant Biology 26: 749-763. - https://doi.org/10.1111/plb.13653
- Bureš P. & Dočkalová Z. (2024): Hordelymus L. - ječmenka. In: Štěpánková J., Chrtek J. jun., Kaplan Z. (eds.). Květena České republiky = Flora of the Czech Republic. 9. Vydání první. Praha: Academia. 717-718.
- Bureš P., Elliott T.L., Veselý P., Šmarda P., Forest F., Leitch I.J., Lughadha E.N., Gomez M.S., Pironon S., Brown M.J.M., Šmerda J. & Zedek F. (2024): The global distribution of angiosperm genome size is shaped by climate. New Phytologist 242: 744-759. - https://doi.org/10.1111/nph.19544
- Danihelka J. & Ducháček M. (2024): Hordeum L. - ječmen. In: Štěpánková J., Chrtek J. jun., Kaplan Z. (eds.). Květena České republiky = Flora of the Czech Republic. 9. Vydání první. Praha: Academia. P 706-716.
- Danihelka J. & Kubát K. (2024): Stipa L.- kavyl. In: Štěpánková J., Chrtek J. jun., Kaplan Z. (eds.). Květena České republiky = Flora of the Czech Republic. 9. Vydání první. Praha: Academia. 389-409.
- Del Guacchio E., Zedek F., Caputo P., Iamonico D. & Bureš P. (2024): The Genus Lophiolepis Is at Least as Well Supported as Afrocarduus, Afrocirsium, and Nuriaea. Comment on Moreyra et al. African Mountain Thistles: Three New Genera in the Carduus-Cirsium Group. Plants 2023, 12, 3083. Plants 13: 3399 [Editorial Material]. - https://doi.org/10.3390/plants13233399
- Dřevojan P., Novák P., Doležal J., Peterka T., Rohel J. & Vlčková P. (2024): Komentované fytocenologické snímky z České republiky 8. Zprávy České botanické společnosti 59: 141-161. - https://botanospol.cz/cs/zpravy-cbs
- Elliott T.L., Spalink D., Larridon I., Zuntini A.R., Escudero M., Hackel J., Barrett R.L., Martín-Bravo S., Márquez-Corro J.I., Mendoza C.G., Mashau A.C., Romero-Soler K.J., Zhigila D.A., Gehrke B., Andrino C.O., Crayn D.M., Vorontsova M.S., Forest F., Baker W.J., Wilson K.L., Simpson D.A. & Muasya A.M. (2024): Global analysis of Poales diversification - parallel evolution in space and time into open and closed habitats. New Phytologist 242: 727-743. - https://doi.org/10.1111/nph.19421
- Filippov P. & Bureš P. (2024): Schoenoplectus (Reichenb.) Palla - skřípinec. In: Štěpánková J., Chrtek J. jun., Kaplan Z. (eds.). Květena České republiky = Flora of the Czech Republic. 9. Vydání první. Praha: Academia. Pp: 131-137.
- Chrtek J. jun., Danihelka J., Dančák M. & Trávníček B. (2024): Bromus L. - sveřep. In: Štěpánková J., Chrtek J. jun., Kaplan Z. (eds.). Květena České republiky = Flora of the Czech Republic. 9. Vydání první. Praha: Academia. Pp. 655-693.
- Kaplan Z., Danihelka J., Prančl J., Chrtek J., Ducháček M., Šumberová K., Nunvářová Kabátová K., Taraška V. & Wild J. (2024): Distributions of vascular plants in the Czech Republic. Part 13. Preslia 96: 1-96. - https://doi.org/10.23855/preslia.2024.001
- Klinkovská K., Glaser M., Danihelka J., Kaplan Z., Knollová I., Novotný P., Pyšek P., Řezníčková M., Wild J. & Chytrý M. (2024): Dynamics of the Czech flora over the last 60 years: Winners, losers and causes of changes. Biological Conservation 292: 110502. - https://doi.org/10.1016/j.biocon.2024.110502
- Larsson D., Šarhanová P., Paun O. & Schneeweiss G.M. (2024): Recent Origin of a Range-Restricted Species With Subsequent Introgression in its Widespread Congener in the Phyteuma spicatum Group (Campanulaceae). Molecular Ecology 34: e17624. - https://doi.org/10.1111/mec.17624
- Lososová Z., Danihelka J., Dřevojan P., Hájek O., Kalusová V., Večeřa M., Chytrý K., Chytrý M., Čeplová N., Filippov P., Jiroušek M., Kadaš D., Kalníková V., Knollová I., Macků M., Niederle J., Novák P., Rohel J., Rotreklová O., Řepka R., Řezníčková M., Šmerdová E., Šumberová K., Veselý P., Vymazalová M., Wirth T. & Tichý L. (2024): Flora of the city of Brno, Czech Republic. Preslia 96: 123-147. - https://doi.org/10.23855/preslia.2024.123
- Marcenò C., Danihelka J., Dziuba T., Willner W. & Chytrý M. (2024): Nomenclatural revision of the syntaxa of European coastal dune vegetation. Vegetation Classification and Survey 5: 27-37. - https://doi.org/10.3897/VCS.108560
- Mikulášková E., Peterka T., Šmerda J. & Hájek M. (2024): Next-generation sequencing reveals hidden genomic diversity in glacial relicts: A case study of Meesia triquetra. Journal of Systematics and Evolution 62: 475-488. - https://doi.org/10.1111/jse.13005
- Plačková K., Bureš P., Lysak M.A. & Zedek F. (2024): Centromere drive may propel the evolution of chromosome and genome size in plants. Annals of Botany 134: 1067-1076. - https://doi.org/10.1093/aob/mcae200
- Schnablová R., Bartušková A., Horčičková E., Šmarda P., Klimešová J. & Herben T. (2024): Diversity and functional differentiation of renewal buds in temperate herbaceous plants. New Phytologist 244: 292-306. - https://doi.org/10.1111/nph.20042
- Sochor M., Šarhanová P., Duchoslav M., Konečná M., Hroneš M. & Trávníček B. (2024): Plant kleptomaniacs: geographical genetic patterns in the amphi-apomictic Rubus ser. Glandulosi (Rosaceae) reveal complex reticulate evolution of Eurasian brambles. Annals of Botany 134: 163-178. - https://doi.org/10.1093/aob/mcae050
- Soto Gomez M., Brown M.J.M., Pironon S., Bureš P., Verde Arregoitia L.D., Veselý P., Elliott T.L., Zedek F., Pellicer J., Forest F., Nic Lughadha E. & Leitch I.J. (2024): Genome size is positively correlated with extinction risk in herbaceous angiosperms. New Phytologist 243: 2470-2485. - https://doi.org/10.1111/nph.19947
- Šarhanová P., Majeský Ľ., Sochor & M. (2024): A novel strategy to study apomixis, automixis, and autogamy in plants. Plant Reproduction 37: 379-392. - https://doi.org/10.1007/s00497-024-00499-6
- Šmarda P., Grulich V., Krahulec F. & Kočí K. (2024): Festuca L. - kostřava. In: Štěpánková J., Chrtek J. jun., Kaplan Z. (eds.). Květena České republiky = Flora of the Czech Republic. 9. Vydání první. Praha: Academia. 585-630.
- Štěpánek J. & Danihelka J. (2024): Poaceae Barnhart - lipnicovité, trávy. In: Štěpánková J., Chrtek J. jun., Kaplan Z. (eds.). Květena České republiky = Flora of the Czech Republic. 9. Vydání první. Praha: Academia. Pp. 361-366.
- van Mazijk R., West A.G., Verboom G.A., Elliott T.L., Bureš P. & Muasya A.M. (2024): Genome size variation in Cape schoenoid sedges (Schoeneae) and its ecophysiological consequences. American Journal of Botany 111: e16315. - https://doi.org/10.1002/ajb2.16315
- Vynokurov D., Borovyk D., Chusova O., Davydova A., Davydov D., Danihelka J., Dembicz I., Iemelianova S., Kolomiiets G., Moysiyenko I., Shapoval V., Shynder O., Skobel N., Buzhdygan O. & Kuzemko A. (2024): Ukrainian Plant Trait Database: UkrTrait v. 1.0. Biodiversity Data Journal 12: e118128. - https://doi.org/10.3897/BDJ.12.e118128
- Zedek F., Šmerda J., Halasová A., Adamec L., Veleba A., Plačková K. & Bureš P. (2024): The smallest angiosperm genomes may be the price for effective traps of bladderworts. Annals of Botany 134: 1131-1138. - https://doi.org/10.1093/aob/mcae107
- Zhigila D.A., Elliott T.L., Schmiedel U. & Muasya A.M. (2024): Do phylogenetic community metrics reveal the South African quartz fields as terrestrial-habitat islands? Annals of Botany 133: 833-850. - https://doi.org/10.1093/aob/mcae027
2023
- Antonelli A., Fry C., Smith R.J., Eden J., Govaerts R.H.A., Kersey P., Nic Lughadha E., Onstein R.E., Simmonds M.S.J., Zizka A., Ackerman J.D., Adams V.M., Ainsworth A.M., Albouy C., Allen A.P., Allen S.P., Allio R., Auld T.D., Bachman S.P., Baker W.J., Barrett R.L., Beaulieu J.M., Bellot S., Black N., Boehnisch G., Bogarín D., Boyko J.D., Brown M.J.M., Budden A., Bureš P., Butt N., Cabral A., Cai L., Aguilar-Cano J.A., Chang Y., Charitonidou M., Chau J.H., Cheek M., Chomicki G., Coiro M., Colli-Silva M., Condamine F.L., Crayn D.M. Cribb P., Cuervo-Robayo A.P., Dahlberg A., Deklerck V., Denelle P., Dhanjal-Adams K.L., Druzhinina I., Eiserhardt W.L., Elliott T.L., Enquist B.J., Escudero M., Espinosa-Ruiz S., Fay M.F., Fernández M., Flanagan N.S., Forest F., Fowler R.M., Freiberg M., Gallagher R.V., Gaya E., Gehrke B., Gelwick K., Grace O.M., Granados Mendoza C., Grenié M., Groom Q.J., Hackel J., Hagen E.R., Hágsater E., Halley J.M., Hu A.-Q,, Jaramillo C., Kattge J., Keith D.A., Kirk P., Kissling W.D., Knapp S., Kreft H., Kuhnhäuser B.G., Larridon I., Leão T.C.C., Leitch I.J., Liimatainen K., Lim J.Y., Lucas E., Lücking R., Luján M., Luo A., Magallón S., Maitner B., Márquez-Corro J.I., Martín-Bravo S., Martins-Cunha K., Mashau A.C., Mauad A.V., Maurin O., Medina Lemos R., Merow C., Michelangeli F.A., Mifsud J.C.O., Mikryukov V., Moat J., Monro A.K., Muasya A.M., Mueller G.M., Muellner-Riehl A.N., Nargar K., Negrão R., Nicolson N., Niskanen T., Oliveira Andrino C., Olmstead R.G., Ondo I., Oses L., Parra-Sánchez E., Paton A.J., Pellicer J., Pellissier L., Pennington T.D., Pérez-Escobar O.A., Phillips C., Pironon S., Possingham H., Prance G., Przelomska N.A.S., Ramírez-Barahona S.A., Renner S.S., Rincon M., Rivers M.C., Rojas Andrés B.M., Romero-Soler K.J., Roque N., Rzedowski J., Sanmartín I., Santamaría-Aguilar D., Schellenberger Costa D., Serpell E., Seyfullah L.J., Shah T., Shen X., Silvestro D., Simpson D.A., Šmarda P., Šmerda J., Smidt E., Smith S.A., Solano-Gomez R., Sothers C., Soto Gomez M., Spalink D., Sperotto P., Sun M., Suz L.M., Svenning J.-C., Taylor A., Tedersoo L., Tietje M., Trekels M., Tremblay R.L., Turner R., Vasconcelos T., Veselý P., Villanueva B.S., Villaverde T., Vorontsova M.S., Walker B.E., Wang Z., Watson M., Weigelt P., Wenk E.H., Westrip J.R.S., Wilkinson T., Willett S.D., Wilson K.L., Winter M., Wirth C., Wölke F.J.R., Wright I.J., Zedek F., Zhigila D.A., Zimmermann N.E., Zuluaga A. & Zuntini A.R. (2023): State of the World's Plants and Fungi 2023. Royal Botanic Gardens, Kew. 90 pp. - https://doi.org/10.34885/wnwn-6s63
- Bureš P., Ozcan M., Šmerda J., Michálková E., Horová L., Plačková K., Šmarda P., Elliott T.L., Veselý P., Ćato S., Norouzi M.,Sheidai M. & Zedek F. (2023): Evolution of genome size and GC content in the tribe Carduinae (Asteraceae): rare descending dysploidy and polyploidy, limited environmental control and strong phylogenetic signal. Preslia 95: 185-213. - https://doi.org/10.23855/preslia.2023.185
- Elliott T.L., Larridon I., Barrett R.L., Bruhl J.J., Costa S.M., Escudero M., Hipp A.L., Jiménez-Mejías P., Kirschner J., Luceño M., Márquez-Corro J.I., Martín-Bravo S., Roalson E.H., Semmouri I., Spalink S., Thomas W.W., Villaverde T., Wilson K.L. & Muthama Muasya A. (2023): Addressing inconsistencies in Cyperaceae and Juncaceae taxonomy: Comment on Brožová et al. (2022). Molecular Phylogenetics and Evolution 179: 107665. - https://doi.org/10.1016/j.ympev.2022.107665
- Elliott T.L., Muasya A.M. & Bureš P. (2023): Complex patterns of ploidy in a holocentric plant clade (Schoenus, Cyperaceae) in the Cape biodiversity hotspot. Annals of Botany 131: 143-156. - https://doi.org/10.1093/aob/mcac027
- Hu Y., Yu Z., Gao X., Liu G., Zhang Y., Šmarda P. & Guo Q. (2023): Genetic diversity, population structure, and genome-wide association analysis of ginkgo cultivars. Horticulture Research 10: 1-10. - https://doi.org/10.1093/hr/uhad136
- Hu Y., Zhang Y., Šmarda P., Bureš P. & Guo Q. (2023): Transcriptome and proteome associated analysis of flavonoid metabolism in haploid Ginkgo biloba. International Journal of Biological Macromolecules 224: 306-318. - https://doi.org/10.1016/j.ijbiomac.2022.10.125
- Michálková E., Šmerda J., Plačková K., Knoll A. & Bureš P. (2023): Hybridization may endanger the rare North Apennine endemic Cirsium bertolonii. Plant Systematics and Evolution 309: 20. - https://doi.org/10.1007/s00606-023-01854-2
- Šmarda P., Klem K., Knápek O., Veselá B., Veselá K., Holub P., Kuchař V., Šilerová A., Horová L. & Bureš P. (2023): Growth, physiology, and stomatal parameters of plant polyploids grown under ice age, present-day, and future CO2 concentrations. New Phytologist 239: 399-414. - https://doi.org/10.1111/nph.18955
- Vorel J., Kmentová N., Hahn C., Bureš P. & Kašný M. (2023): An insight into the functional genomics and species classification of Eudiplozoon nipponicum (Monogenea, Diplozoidae), a haematophagous parasite of the common carp Cyprinus carpio. BMC Genomics 24: 363. - https://doi.org/10.1186/s12864-023-09461-8
2022
- Boeuf R., Hardion L., Šmarda P., Lazare J.-J., Thébaud G., Gregor T., Portal R., Höcker R., Mazas S.R., Besnard G. & Holveck P. (2022): Des Carpates aux Pyrénées, centrées sur l' lsace et les Vosges, analyses génétiques de quelques fétuques à feuilles fines (Festuca sect Festuca) estiméed'intérêt régional à européen : considérations taxinomiques et syntaxinomiues. Botanique 8: 37-133.
- Bureš P. (2022): Biosystematika rostlin (1999-2022). In: GELNAR, Milan a Zuzana JAYASUNDERA, ed. Dějiny psané přírodovědci: Vývoj vědních oborů na Přírodovědecké fakultě Masarykovy univerzity. Brno: Masarykova univerzita, 2022. ISBN 978-80-280-0088-2. Pp. 223-236.
- Bureš P. (2022): Botanická knihovna - největší dílčí knihovna na fakultě. In: GELNAR, Milan a Zuzana JAYASUNDERA, ed. Dějiny psané přírodovědci: Vývoj vědních oborů na Přírodovědecké fakultě Masarykovy univerzity. Brno: Masarykova univerzita, 2022. ISBN 978-80-280-0088-2. Pp. 248-251.
- Bureš P. (2022): Botanické pracoviště po druhé světové válce a v éře socialismu (1945-1989). In: GELNAR, Milan a Zuzana JAYASUNDERA, ed. Dějiny psané přírodovědci: Vývoj vědních oborů na Přírodovědecké fakultě Masarykovy univerzity. Brno: Masarykova univerzita, 2022. ISBN 978-80-280-0088-2. Pp. 164-193.
- Bureš P. (2022): Studenti a jejich absolventské práce z botaniky v uplynulých sto letech. In: GELNAR, Milan a Zuzana JAYASUNDERA, ed. Dějiny psané přírodovědci: Vývoj vědních oborů na Přírodovědecké fakultě Masarykovy univerzity. Brno: Masarykova univerzita, 2022. ISBN 978-80-280-0088-2. Pp. 255-261.
- Bureš P. (2022): Založení botanického ústavu, budování výuky, herbářů, zahrady a knihovny (1921-1945). In: GELNAR, Milan a Zuzana JAYASUNDERA, ed. Dějiny psané přírodovědci: Vývoj vědních oborů na Přírodovědecké fakultě Masarykovy univerzity. Brno: Masarykova univerzita, 2022. ISBN 978-80-280-0088-2. Pp. 145-163.
- Bureš P. & Chytrý M. (2022): Obnova botanické výuky a výzkumu po roce 1989 a spojení s Katedrou zoologie a ekologie (1990-2005). In: GELNAR, Milan a Zuzana JAYASUNDERA, ed. Dějiny psané přírodovědci: Vývoj vědních oborů na Přírodovědecké fakultě Masarykovy univerzity. Brno: Masarykova univerzita, 2022. ISBN 978-80-280-0088-2. Pp. 194-209.
- Del Guacchio E., Bureš P., Iamonico D., Carucci F., De Luca D., Zedek F. & Caputo P. (2022): Towards a monophyletic classification of Cardueae: restoration of the genus Lophiolepis (= Cirsium p.p.) and new circumscription of Epitrachys. Plant Biosystems 156: 1269-1290. - https://doi.org/10.1080/11263504.2022.2131924
- Elliott T.L., Zedek F., Barrett R.L., Bruhl J.J., Escudero M., Hroudová Z., Joly S., Larridon I., Luceño M., Márquez-Corro J.I., Martín-Bravo S., Muasya A.M., Šmarda P., Thomas W.W., Wilson K.L. & Bureš P. (2022): Chromosome size matters: genome evolution in the cyperid clade. Annals of Botany 130: 999-1014. - https://doi.org/10.1093/aob/mcac136
- Hu Y., Šmarda P., Liu G., Wang B., Gao X. & Guo Q. (2022): High-Depth Transcriptome Reveals Differences in Natural Haploid Ginkgo biloba L. Due to the Effect of Reduced Gene Dosage. International Journal of Molecular Sciences 23: 8958. - https://doi.org/10.3390/ijms23168958
- Chytrý M. & Rotreklová O. (2022): Vít Grulich (1956-2022) - botanik, učitel, ochranář, cestovatel a popularizátor. Živa 6: CLIII-CLV - https://ziva.avcr.cz
- Kaplan Z., Danihelka J., Chrtek J.Jr., Prančl J., Grulich V., Jelínek B., Úradníček L., Řepka R., Šmarda P., Vašut R.J. & Wild J. (2022): Distributions of vascular plants in the Czech Republic. Part 11. Preslia 94: 335-427. - https://doi.org/10.23855/preslia.2022.335
- Mady M., Celle J., Boeuf R., Portal R., Šmarda P. & Vergne T. (2022): Le système pelousaire thermoxérique des gorges de la Tardes et du Haut Cher (nord du Massif central). Botanique 8: 153-197.
- Plačková K., Zedek F., Schubert V., Houben A. & Bureš P. (2022): Kinetochore size scales with chromosome size in bimodal karyotypes of Agavoideae. Annals of Botany 130: 77-84. - https://doi.org/10.1093/aob/mcac063
- Sliwinska E., Loureiro J., Leitch I.J., Šmarda P., Bainard J., Bureš P., Chumová Z., Horová L., Koutecký P., Lučanová M., Trávníček P. & Galbraith D.W. (2022): Application-based guidelines for best practices in plant flow cytometry. Cytometry Part A 101: 749-781. - https://doi.org/10.1002/cyto.a.24499
- Štencl R., Chrtek J., Rotreklová O. & Bräutigam S. (2022): Chlupáčky (rod Pilosella) chráněné krajinné oblasti Jeseníky. Zprávy České botanické společnosti 57: 177-218.
- Temsch E.M., Koutecký P., Urfus T., Šmarda P. & Doležel J. (2022): Reference standards for flow cytometric estimation of absolute nuclear DNA content in plants. Cytometry part A 101: 710-724. - https://doi.org/10.1002/cyto.a.24495
- Zedek F., Veselý P., Tichý L., Elliott T.L., Garbolino E., De Ruffray P. & Bureš P. (2022): Holocentric plants are more competitive under higher UV-B doses. New Phytologist 233: 15-21. - https://doi.org/10.1111/nph.17750
2021
- Elliott T.L., van Mazijk R., Barrett R.L., Bruhl J.J., Joly S., Muthaphuli N., Wilson K.L. & Muasya A.M. (2021): Global dispersal and diversification of the genus Schoenus (Cyperaceae) from the Western Australian biodiversity hotspot. Journal of Systematics and Evolution 59: 791-808. - https://doi.org/10.1111/jse.12742
- Galbraith D., Loureiro J., Antoniadi I., Bainard J., Bureš P., Cápal P., Castro M., Castro S., Čertner M., Čertnerová D., Chumová Z., Doležel J., Giorgi D., Husband B.C, Kolář F., Koutecký P., Kron P., Leitch I.J., Ljung K., Lopes S., Lučanová M., Lucretti S., Ma W., Melzer S., Molnár I., Novák O., Poulton N., Skalický V., Sliwinska E., Šmarda P., Smith T.W., Sun G., Talhinhas P., Tárnok A., Temsch E.M., Trávníček P., Urfus & T. (2021): Best practices in plant cytometry. Cytometry Part A. 99: 311-317. - https://doi.org/10.1002/cyto.a.24295
- Kaplan Z., Danihelka J., Dřevojan P., Řepka R., Koutecký P., Grulich V. & Wild J. (2021): Distributions of vascular plants in the Czech Republic. Part 10. Preslia 93: 255-304. - http://dx.doi.org/10.23855/preslia.2021.255
- Kiedrzyński M., Zielińska K.M., Jedrzejczyk I., Kiedrzyńska E., Tomczyk P.P., Rewicz A., Rewers M., Indreica A., Bednarska I., Stupar V., Roleček J. & Šmarda P. (2021): Tetraploids expanded beyond the mountain niche of their diploid ancestors in the mixed-ploidy grass Festuca amethystina L. Scientific Reports 11: 18735. - https://doi.org/10.1038/s41598-021-97767-6
- Krátká M., Šmerda J., Lojdová K., Bureš P. & Zedek F. (2021): Holocentric Chromosomes Probably Do Not Prevent Centromere Drive in Cyperaceae. Frontiers in Plant Science 12: 642661. - https://doi.org/10.3389/fpls.2021.642661
- Larridon I., Zuntini A.R., Léveillé-Bourret É., Barrett R.L., Starr J.R., Muasya A.M., Villaverde T., Bauters K., Brewer G.E., Bruhl J.J., Costa S.M., Elliott T.L., Epitawalage N., Escudero M., Fairlie I., Goetghebeur P., Hipp A.L., Jiménez-Mejías P., Kikuchi I.A.B.S., Luceño M., Márquez-Corro J.I., Martín-Bravo S., Maurin O., Pokorny L., Roalson E.H., Semmouri I., Simpson D.A., Spalink D., Thomas W.W., Wilson K.L., Xanthos M., Forest F. & Baker W.J. (2021): A new classification of Cyperaceae (Poales) supported by phylogenomic data. Journal of Systematics and Evolution 59: 852-895. - https://doi.org/10.1111/jse.12757
- Pellicer J., Fernández P., Fay M.F., Michálková E. & Leitch I. (2021): Genome Size Doubling Arises From the Differential Repetitive DNA Dynamics in the Genus Heloniopsis (Melanthiaceae). Frontiers in Genetics 12: 726211. - https://doi.org/10.3389/fgene.2021.726211
- Plačková K., Bureš P. & Zedek F. (2021): Centromere size scales with genome size across Eukaryotes. Scientific Reports volume 11: 19811. - https://doi.org/10.1038/s41598-021-99386-7
- Schnablová R., Huang L., Klimešová K., Šmarda P. & Herben T. (2021): Inflorescence preformation prior to winter: a surprisingly widespread strategy that drives phenology of temperate perennial herbs. New Phytologist 229: 620-630. - https://doi.org/10.1111/nph.16880
- Zedek F., Šmerda J., Veselý P., Horová L., Kocmanová J. & Bureš P. (2021): Elevation-dependent endopolyploid response suggests that plants with holocentric chromosomes are less stressed by UV-B. Botanical Journal of the Linnean society 195: 106-113. - https://doi.org/10.1093/botlinnean/boaa054
2020
- Kaplan Z., Danihelka J., Ekrt L., Štech M., Řepka R., Chrtek J. Jr., Grulich V., Rotreklová O., Dřevojan P. & Šumberová K. Wild J. (2020): Distributions of vascular plants in the Czech Republic. Part 9. Preslia 92: 255-340. - http://dx.doi.org/10.23855/preslia.2020.255
- Penner S., Dror B., Aviezer I., Bar-Lev Y., Salman-Minkov Y., Mandakova T., Šmarda P., Mayrose I. & Sapir Y. (2020): Phenology and polyploidy in annual Brachypodium species (Poaceae) along the aridity gradient in Israel. Journal of Systematics and Evolution 58:189-199. - http://dx.doi.org/10.1111/jse.12489
- Veleba A., Zedek F., Horová L., Veselý P., Srba M., Šmarda P. & Bureš P. (2020): Is the evolution of carnivory connected with genome size reduction? American Journal of Botany 107: 1253-1259. - https://doi.org/10.1002/ajb2.1526
- Veselý P., Šmarda P., Bureš P., Stirton c., Muthama Muasya A., Mucina L., Horová L., Veselá K., Šilerová A., Šmerda J. & Knápek O. (2020): Environmental pressures on stomatal size may drive plant genome size evolution: evidence from a natural experiment with Cape geophytes. Annals of Botany 126: 323-330. - https://doi.org/10.1093/aob/mcaa095
- Zedek F., Plačková K., Veselý P., Šmerda J., Šmarda P., Horová L. & Bureš P. (2020): Endopolyploidy is a common response to UV-B stress in natural plant populations, but its magnitude may be affected by chromosome type. Annals of Botany 126: 883-889. - https://doi.org/10.1093/aob/mcaa109
2019
- Boeuf R., Berchtold J.-P., Šmarda P., Gregor T., Viane R., Holveck P. & Nguefack J. (2019): Les fétuques du massif vosgien et des territoires ou contrées avoisinants: quelques taxons méconnus, inédits ou nouveaux pour l'Alsace, la dition, la France ou plus largement pour la flore. Botanique 5: 5-47
- Král J., Forman M., Kořínková T., Lerma A.C.R., Haddad C.R., Musilová J., Řezáč M., Herrer I.M.Á., Thakur S., Dippenaar-Schoeman A.S., Marec F., Horová L. & Bureš P. (2019): Insights into the karyotype and genome evolution of haplogyne spiders indicate a polyploid origin of lineage with holokinetic chromosomes. Scientific Reports 9: 3001. - http://dx.doi.org/10.1038/s41598-019-39034-3
- Michálková E. & Bureš P. (2019): Pcháč Sudův - nejvzácnější ze vzácných kříženců. Živa 2: 63-66.
- Šmarda P., Knápek O., Březinová A., Horová L., Grulich V., Danihelka J., Veselý P., Šmerda J., Rotreklová O. & Bureš P. (2019): Genome sizes and genomic guanine+cytosine (GC) contents of the Czech vascular flora with new estimates for 1700 species. Preslia 91: 117-142. - http://dx.doi.org/10.23855/preslia.2019.117
- Zedek F. & Bureš P. (2019): Pest Arthropods with Holocentric Chromosomes are More Resistant to Sterilizing Ionizing Radiation. Radiation Research 191: 255-261. - http://dx.doi.org/10.1667/RR15208.1
2018
- Bureš P., Šmerda J., Michálková E., Šmarda P., Knoll A. & Vavrinec M. (2018): Cirsium greimleri: a new species of thistle endemic to the Eastern Alps and Dinarides. Preslia 90: 105-134. - fulltext pdf file
- Kaplan Z., Danihelka J., Chrtek J. Jr., Prančl J., Ducháček M., Ekrt L., Kirschner J., Brabec J., Zázvorka J., Trávníček B., Dřevojan P., Šumberová K., Kocián P., Wild J. & Petřík P. (2018): Distributions of vascular plants in the Czech Republic. Part 7. Preslia 90: 425-531. - fulltext pdf file
- Kaplan Z., Koutecký P., Danihelka J., Šumberová K., Ducháček M., Štěpánková J., Ekrt L., Grulich V., Řepka R., Kubát K., Mráz P., Wild J. & Brůna J. (2018): Distributions of vascular plants in the Czech Republic. Part 6. Preslia 90: 235-346. - fulltext pdf file
- Kolodin P., Cempírková H., Bureš P., Horová L., Veleba A., Francová J., Adamec J. & Zedek F. (2018): Holocentric chromosomes may be an apomorphy of Droseraceae. Plant Systematics and Evolution 304: 1289-1296. - fulltext on SpringerLink
- Michálková E., Šmerda J., Knoll A. & Bureš P. (2018): Cirsium xsudae: a new interspecific hybrid between rare Alpine thistles. Preslia 90: 347-365. - fulltext pdf file
- Roleček J., Fajmon K. & Šmarda P. (2018): Nález hořčíku jestřábníkovitého velkoúborného (Picris hieracioides subsp. umbellata) v NPR Porážky (Bílé Karpaty) a poznámky k jeho výskytu v České republice. Zprávy České botanické společnosti 53: 165-176.
- Schulz B., Durka W., Danihelka J. & Eckstein R.L. (2018): Differential role of a persistent seed bank for genetic variation in early vs. late successional stages. PLoS ONE 13: e0209840 - fulltext in pdf
- Šmarda P., Horová L., Knápek O., Dieck H., Dieck M., Ražná K., Hrubík P., Orlóci L., Papp L., Veselá K., Veselý P. & Bureš P. (2018): Multiple haploids, triploids, and tetraploids found in modern-day "living fossil" Ginkgo biloba. Horticulture Research 5: 55. - fulltext on nature.com
- Zedek F. & Bureš P. (2018): Holocentric chromosomes: from tolerance to fragmentation to colonization of the land. Annals of Botany 121: 9-16 [Editorial Material]. - Fulltext in Oxford Journals
2017
- Grulich V. (2017): Červený seznam cévnatých rostlin ČR. In: Grulich V., Chobot K. (eds.). Červený seznam ohrožených druhů České republiky. Cévnaté rostliny - Příroda, Praha 35: 75-132.
- Grulich V. (2017): Historie českých červených seznamů cévnatých rostlin. Grulich V., Chobot K. (eds.). Červený seznam ohrožených druhů České republiky. Cévnaté rostliny - Příroda, Praha 35: 36-46.
- Chobot K., Plesník J. & Grulich V. (2017): Kategorie a kritéria IUCN a jejich použití pro červené seznamy cévnatých rostlin ČR. In: Grulich V., Chobot K. (eds.). Červený seznam ohrožených druhů České republiky. Cévnaté rostliny - Příroda, Praha 35: 47-74.
- Kaplan Z., Danihelka J., Koutecký P., Šumberová K., Ekrt L., Grulich V., Řepka R., Hroudová Z., Štěpánková J., Dvořák V., Dančák M., Dřevojan P. & Wild J. (2017): Distributions of vascular plants in the Czech Republic. Part 4. Preslia 89: 115-201. - fulltext pdf file
- Lepší P., Paulič R., Boublík K., Čech L., Grulich V., Hoffmann A., Chrtek J., Janáková J., Jírová J., Karlík P., Lepší M., Lippl L., Prach K., Půbal D., Štech M., Štěpánek, J. Těšitel J. & Velebil J. (2017): Výsledky floristického kurzu České botanické společnosti v Prachaticích (8. 7. - 13. 7. 2012). Zprávy České botanické společnosti, Příloha 52: 1-69.
- Mikulášková E., Veleba A., Šmerda J., Knoll A. & Hájek M. (2017): Microsatellite variation in three calcium-tolerant species of peat moss detected specific genotypes of Sphagnum warnstorfii on magnesium-rich bedrock. Preslia 89: 101-114. - fulltext pdf file
- Palpurina S., Wagner V., von Wehrden H., Hájek M., Horsák M., Brinkert A., Hölzel N., Wesche K., Kamp J., Hájková P., Danihelka J., Lustyk P., Merunková K., Preislerová Z., Kočí M., Kubešová S., Cherosov M., Ermakov N., German D., Gogoleva P., Lashchinsky N., Martynenko V. & Chytrý M. (2017): The relationship between plant species richness and soil pH vanishes within creasing aridity across Eurasian drygrasslands. Global Ecology and Biogeography 26: 425-434. - fulltext in Wiley Online Library
- Veleba A., Šmarda P., Zedek F., Horová L., Šmerda J. & Bureš P. (2017): Evolution of genome size and genomic GC content in carnivorous holokinetics (Droseraceae). Annals of Botany 119: 409-416. - Fulltext in Oxford Journals
- Vydrová A. & Grulich V. (2017): Osm botanicky cenných lokalit v okolí Horní Plané. Silva Gabreta 23: 1-18. - fulltext in pdf
- Wagner V., Chytrý M., Zelený D., von Wehrden H., Brinkert A., Danihelka J., Hölzel N., Jansen F., Kamp J., Lustyk P., Merunková K., Palpurina S., Preislerová Z. & Wesche K. (2017): Regional differences in soil pH niche among dry grassland plants in Eurasia. Oikos 126: 660-670. - fulltext in Wiley Online Library
2016
- Bidmanová P., Rotreklová O., Danihelka J. & Chrtek J. (2016): Autumn hawkweed (Hieracium sabaudum) in the Czech Republic. Acta Musei Moraviae, Scientiae Biologicae 101: 101-158.
- Danihelka J. (2016): Ad Additamenta XIII correctiones minores. Zprávy České botanické společnosti 51: 185-187.
- Grulich V. (2016): Mokřady. In: Chobot, K. (ed.). Druhy a přírodní stanoviště: Hodnotící zprávy o stavu v České republice. Praha : Agentura ochrany přírody a krajiny ČR a Ministerstvo životního prostředí. 226 s. Pp. 25-29.
- Grulich V. & Májeková J. (2016): Polygonum aviculare L. In: Goliašová K., Michalková E. Flóra Slovenska 6/4. Bratislava: Veda. Pp. 506-515.
- Hodálová I., Goliašová K., Michalková E., Danihelka J., Zaliberová M. & Uherčíková E. (2016): Persicaria (L.) Mill. In: Goliašová K., Michalková E. Flóra Slovenska 6/4. Bratislava: Veda. Pp. 516-550.
- Chytrý M., Hennekens S.M., Jiménez-Alfaro B., Knollová I., Dengler J., Jansen F., Landucci F., Schaminée J.H.J., Aćić S., Agrillo E., Ambarlı D., Angelini P., Apostolova I., Attorre F., Berg C., Bergmeier E., Biurrun I., Botta-Dukát Z., Brisse H., Campos J.A., Carlón L., Čarni A., Casella L., Csiky J., Ćušterevska R., Stevanović Z.D., Danihelka J., De Bie E., de Ruffray P., De Sanctis M., Dickoré W.B., Dimopoulos P., Dubyna D., Dziuba T., Ejrnæs R., Ermakov N., Ewald J., Fanelli G., Fernández-González F., FitzPatrick Ú., Font X., García-Mijangos I., Gavilán R.G., Golub V., Guarino R., Haveman R., Indreica A., Işik Gürsoy D., Jandt U., Janssen J.A.M., Jiroušek M., Kącki Z., Kavgacı A., Kleikamp M., Kolomiychuk V., Krstivojević Ćuk M., Krstonošić D., Kuzemko A., Lenoir J., Lysenko T., Marcenò C., Martynenko V., Michalcová D., Moeslund J.E., Onyshchenko V., Pedashenko H., Pérez-Haase A., Peterka T., Prokhorov V., Rašomavičius V., Rodríguez-Rojo M.P., Rodwell J.S., Rogova T., Ruprecht E., Rūsiņa S., Seidler G., Šibík J., Šilc U., Škvorc Ž., Sopotlieva D., Stančić Z., Svenning J.-C., Swacha G., Tsiripidis I., Turtureanu P.D., Uğurlu E., Uogintas D., Valachovič M., Vashenyak Y., Vassilev K., Venanzoni R., Virtanen R., Weekes L., Willner W., Wohlgemuth T. & Yamalov S. (2016): European Vegetation Archive (EVA): an integrated database of European vegetation plots. Applied Vegetation Science 19: 173-180 [Report] - fulltext in Wiley Online Library
- Kaplan Z., Danihelka J., Lepší M., Lepší P., Ekrt L., Chrtek J. Jr., Kocián J., Prančl J., Kobrlová L., Hroneš M. & Šulc V. (2016): Distributions of vascular plants in the Czech Republic. Part 3. Preslia 88: 459-544. - fulltext pdf file
- Kaplan Z., Danihelka J., Štěpánková J., Ekrt L., Chrtek J., Zázvorka J., Grulich V., Řepka R., Prančl J., Ducháček M., Kúr P., Šumberová K. & Brůna J. (2016): Distributions of vascular plants in the Czech Republic. Part 2. Preslia 88: 229-322. - fulltext pdf file
- Kocián P., Danihelka J., Lengyel A., Chrtek J. Jun., Ducháček M. & Kúr P. (2016): Limonka Gmelinova (Limonium gmelinii) na dálnicích České republiky. Acta Rerum Naturalium 19: 1-6.
- Lososová Z., Čeplová N., Chytrý M., Tichý L., Danihelka J., Fajmon K., Láníková D., Preislerová Z. & Řehořek V. (2016): Is phylogenetic diversity a good proxy for functional diversity of plant communities? A case study from urban habitats. Journal of Vegetation Science 27: 1036-1046. - fulltext in Wiley Online Library
- Lososová Z., Chytrý M., Danihelka J., Tichý L. & Ricotta C. (2016): Biotic homogenization of urban floras by alien species: the role of species turnover and richness differences. Journal of Vegetation Science 27: 452-459. - fulltext in Wiley Online Library
- Pergl J., Sádlo J., Petřík P., Danihelka J., Chrtek J., Hejda M., Moravcová L., Perglová I., Štajerová K. & Pyšek P. (2016): Dark side of the fence: ornamental plants as a source of wild-growing flora in the Czech Republic. Preslia 88: 163-184. - fulltext pdf file
- Rotreklová O. & Krahulcová A. (2016): Estimating paternal efficiency in an agamic polyploid complex: pollen stainability and variation in pollen size related to reproduction mode, ploidy level and hybridogenous origin in Pilosella (Asteraceae). Folia Geobotanica 51: 175-186. - fulltext on SpringerLink
- Šmarda P., Veselý P., Šmerda J., Bureš P., Knápek O. & Chytrá M. (2016): Polyploidy in a 'living fossil' Ginkgo biloba. New Phytologist 212: 11-14. - fulltext in Wiley Online Library
- Zedek F. & Bureš P. (2016): Absence of positive selection on CenH3 in Luzula suggests that holokinetic chromosomes may suppress centromere drive. Annals of Botany 118: 1347-1352.
- Zedek F. & Bureš P. (2016): CenH3 evolution reflects meiotic symmetry as predicted by the centromere drive model. Scientific Reports 6: 33308.
- Zedek F., Veselý P., Horová L. & Bureš P. (2016): Flow cytometry may allow microscope-independent detection of holocentric chromosomes in plants. Scientific Reports 6: 27161.
2015
- Čeplová N., Lososová Z., Zelený D., Chytrý M., Danihelka J., Fajmon K., Láníková D., Preislerová Z., Řehořek V. & Tichý L. (2015): Phylogenetic diversity of central-European urban plant communities: effects of alien species and habitat types. Preslia 87: 1-16. - fulltext in pdf
- Hirsch H., Wagner V., Danihelka J., Ruprecht E., Sánchez-Gómez P., Seifert M. & Hensen I. (2015): High genetic diversity declines towards the geographic range periphery of Adonis vernalis, a Eurasian dry grassland plant. Plant Biology 17: 1233-1241. - fulltext in Wiley Online Library
- Horsák M., Chytrý M., Hájková P., Hájek M., Danihelka J., Horsáková V., Ermakov N., German D.A., Kočí M., Lustyk P., Nekola J.C., Preislerová Z. & Valachovič M. (2015): European glacial relict snails and plants: environmental context of their modern refugial occurrence in southern Siberia. Boreas 44: 638-657. - fulltext on Wiley Online Library
- Chytrý M. & Danihelka J. (2015): Panicum virgatum L. Zprávy České botanické společnosti 50: 83-85.
- Chytrý M., Danihelka J., Michalcová D., Chytrá M., Daněk P., Grulich V., Hédl R., Jongepier J.W., Jongepierová I., Kočí M., Novák P., Peterka T., Roleček J., Šumberová K. & Tichý L. (2015): Botanical excursions in Moravia. Brno : Masaryk University. 228 pp.
- Kaplan Z., Danihelka J., Štěpánková J., Bureš P., Zázvorka J., Hroudová Z., Ducháček M., Grulich V., Řepka R., Dančák M., Prančl J., Šumberová K., Wild J. & Trávníček B. (2015): Distributions of vascular plants in the Czech Republic. Part 1. Preslia 87: 417-500.
- Palpurina S., Chytrý M., Tzonev R., Danihelka J., Axmanová I., Merunková K., Duchoň M. & Karakiev T. (2015): Patterns of fine-scale plant species richness in dry grasslands across the eastern Balkan Peninsula. Acta Oecologica - International Journal of Ecology 63: 36-46. - fulltext on ScienceDirect
- Pyšek P., Manceur A.M., Alba C., McGregor K.F., Pergl J., Štajerová K., Chytrý M., Danihelka J., Kartesz J., Klimešová J., Lučanová M., Moravcová L., Nishino M., Sádlo J., Suda J., Tichý L. & Kühn I. (2015): Naturalization of central European plants in North America: species traits, habitats, propagule pressure, residence time. Ecology 96: 762-774. - fulltext in ESA Journals
2014
- Bureš P. & Zedek F. (2014): Holokinetic drive: centromere drive in chromosomes without centromeres. Evolution; international journal of organic evolution 68: 2412-2420. - fulltext in Wiley Online Library
- Danihelka J. (2014): Bromus bromoideus (Lej.) Crép. Zprávy České botanické společnosti 49: 86-91.
- Grulich V. (2014): Výsledky floristického kurzu České botanické společnosti v Třebíči (3.-8. července 2011). Zprávy České botanické společnosti 49: 1-94.
- Jiménez-Mejías P., Hilpold A., Frajman B., Puşcaş M., Koopman J., Mesterházy A., Grulich V., Lye K.A. & Martín-Bravo S. (2014): Carex cespitosa: reappraisal of its distribution in Europe. Willdenowia 44: 327-343. - fulltext on BioOne
- Kaplan Z. & Danihelka J. (2014): Erichloa procera (Retz.) C. E. Hubb. Zprávy České botanické společnosti 49: 122-124.
- Krahulcová A., Rotreklová O. & Krahulec F. (2014): The Detection, Rate and Manifestation of Residual Sexuality in Apomictic Populations of Pilosella (Asteraceae, Lactuceae). Folia Geobotanica 49: 239-258.
- Lososová Z. & Danihelka J. (2014): Proč je flóra velkoměst pestrá. Živa 6: 278-281.
- Michalcová D., Chytrý M., Pechanec V., Hájek O., Jongepier J.W., Danihelka J., Grulich V., Šumberová K., Preislerová Z., Ghisla A., Bacaro G. & Zelený D. (2014): High plant diversity of grasslands in a landscape context: A comparison of contrasting regions in central Europe. Folia Geobotanica 49: 117-135. - fulltext on SpringerLink
- Motlašová H., Rotreklová O., Danihelka J., Gottschlich G. & Chrtek J. Jun. (2014): Jestřábník hroznatý (Hieracium racemosum) v České republice. Česká botanické společnost 49: 1-27.
- Novotná S., Danihelka J., Rotreklová O. & Chrtek J. Jun. (2014): Jestřábník okoličnatý (Hieracium umbellatum) v České republice. Acta rerum naturalium 15: 73-95.
- Řepka R. & Grulich V. (2014): Ostřice České republiky. Praha: Lesnická Práce 208 pp.
- Šmarda P., Bureš P., Horová L., Leitch I.J., Mucina L., Pacini E., Tichý L., Grulich V. & Rotreklová O. (2014): Ecological and evolutionary significance of genomic GC content diversity in monocots. Proceedings of the National Academy of Sciences of the USA (PNAS) 111: E4096-E4102.
- Veleba A., Bureš P., Adamec L., Šmarda P., Lipnerová I. & Horová L. (2014): Genome size and genomic GC content evolution in the miniature genome-sized family Lentibulariaceae. New Phytologist 203: 22-28. - fulltext in Wiley Online Library
2013
- Axmanová I., Chytrý M., Danihelka J., Lustyk P., Kočí M., Kubešová S., Horsák M., Cherosov M.M. & Gogoleva P.A. (2013): Plant species richness-productivity relationships in a low-productive boreal region. Plant Ecology 214: 207-219. - fulltext on SpringerLink
- Boubík K., Brabec J., Bureš P., Danihelka J., Douda J., Ducháček M., Ekrt L., Ekrtová E., Grulich V., Hans V., Havlíček P., Hesoun P., Hroudová Z., Chán V., Chrtek J., Janáková J., Kaplan Z., Kirschnerová L., Kolář F., Košnar J., Koutecký P., Kúr P., Lepší M., Lippl L., Lučanová M., Paulič R., Pavlíčko A., Průša D., Průšová M., Půbal D., Rektoris L., Řepka R., Soukup M., Štech M., Štěpánková J., Šumberová K., Trávníček B., Vaněček Z., Vydrová A. & Žíla V. (2013): Červená kniha květeny jižní části Čech. České Budějovice: Jihočeské muzeum v Českých Budějovicích. 503 pp.
- Bureš P., Zedek F. & Marková M. (2013): Holocentric chromosomes. In: Wendel J., Greilhuber J., Doležel J. & Leitch IJ. [eds.]. Plant Genome Diversity. Vol. 2. Physical structure of plant genomes. Heidelberg : Springer Verlag. Pp. 187-208.
- Danihelka J. (2013): Botanické součty, rozdíly a podíly. Živa 61: 69-72.
- Danihelka J. (2013): Corispermum gmelinii Bunge. Zprávy České botanické společnosti 48: 71-75.
- Chytrý M., Douda J., Roleček J., Sádlo J., Boublík K., Hédl R., Vítková M., Zelený D., Navrátilová J., Neuhäuslová Z., Petřík P., Kolbek J., Lososová Z., Šumberová K., Hrivnák R., Michalcová D., Žáková K., Danihelka J., Tichý L., Zouhar V., Hájek O. & Kočí M. (2013): Vegetace České republiky 4. Lesní a křovinná vegetace. Vegetation of the Czech Republic 4. Forest and scrub vegetation. Praha : Academia. 552 pp. - Contributors and contents + Academia website
- Lipnerová I., Bureš P., Horová L. & Šmarda P. (2013): Evolution of genome size in Carex (Cyperaceae) in relation to chromosome number and genomic base composition. Annals of Botany 111: 79-94. - fulltext on Oxford journals
- Slancarova V., Zdanska J., Janousek B., Talianova M., Zschach Ch., Zluvova J., Siroky J., Kovacova V., Blavet H., Danihelka D., Oxelman B., Widmer A. & Vyskot B. (2013): Evolution of sex determination systems with heterogametic males and females in Silene. Evolution; international journal of organic evolution 67: 3669-3677.
- Šmarda P., Hejcman M., Březinová A., Horová L., Steigerová H., Zedek F., Bureš P., Hejcmanová P. & Schellberg J. (2013): Effect of phosphorus availability on the selection of species with different ploidy levels and genome sizes in a long-term grassland fertilization experiment. New Phytologist 200: 911-921.
- Veselý P., Bureš P. & Šmarda P. (2013): Nutrient reserves may allow for genome size increase: evidence from comparison of geophytes and their sister non-geophytic relatives. Annals of Botany 112: 1193-1200.
2012
- Axmanová I., Chytrý M., Zelený D., Li C.-F., Vymazalová M., Danihelka J., Horsák M., Kočí M., Kubešová S., Lososová Z., Otýpková Z., Tichý L., Martynenko V.B., Baisheva E.Z., Schuster B. & Diekmann M. (2012): The species richness-productivity relationship in the herb layer of European deciduous forests. Global Ecology and Biogeography 21: 657-667. - fulltext in Wiley Online Library
- Danihelka J., Chrtek J. Jr. & Kaplan Z. (2012): Checklist of vascular plants of the Czech Republic. Preslia 84: 647-811.
- Danihelka J. & Soják J. (2012): Potentilla x nebulosa (Rosaceae), a new intersectional nothospecies from the Altai Mountains. Turczaninowia 5: 5-8. - fulltext in pdf
- Dengler J., Berendsohn W.G., Bergmeier E., Chytrý M., Danihelka J., Jansen F., Kusber W-H., Landucci F., Müller A., Panfili E., Schaminée J.H.J., Venanzoni R. & von Raab-Straube E. (2012): The need for and the requirements of EuroSL, an electronic taxonomic reference list of all Euro-pean plants. Biodiversity & Ecology 4: 15-24. - fulltext pdf file
- Eliáš P., Grulich V., Dítě D. & Senko D. (2012): Distribution and ecology of Carex secalina in the Czech Republic and Slovakia. Acta Societatis Botanicorum Poloniae 81: 93-99.
- Foggi B., Parolo G., Šmarda P., Coppi A., Lastrucci L., Lakušić A., Eastwood R. & Rossi G. (2012): Revision of the Festuca alpina group (Festuca section Festuca, Poaceae) in Europe. Botanical Journal of the Linnean Society 170: 618-639. - fulltext in Wiley Online Library
- Grulich V. (2012): Red List of vascular plants of the Czech Republic: 3rd edition. Preslia 84: 631-645.
- Chytrý M., Ermakov N., Danihelka J., Hájek M., Hájková P., Horsák M., Kočí M., Kubešová S., Lustyk P., Otýpková Z., Pelánková B., Valachovič M. & Zelený D. (2012): High species richness in hemiboreal forests of the northern Russian Altai, southern Siberia. Journal of Vegetation Science 23: 605-616. - fulltext in Wiley Online Library
- Chytrý M., Lososová Z., Horsák M., Uher B., Čejka T., Danihelka J., Fajmon K., Hájek O., Juřičková L., Kintrová K., Láníková D., Otýpková Z., Řehořek V. & Tichý L. (2012): Dispersal limitation is stronger in communities of microorganisms than macroorganisms across Central European cities. Journal of Biogeography 39: 1101-1111. - fulltext in Wiley Online Library
- Chytrý M., Pyšek P., Kaplan Z. & Danihelka J. (2012): Flora and vegetation of the Czech Republic: introduction to special issue dedicated to the centenary of the Czech Botanical Society. Preslia 84: 393-396. - fulltext pdf file
- Letz D.R., Dančák M., Danihelka J. & Šarhanová P. (2012): Taxonomy and distribution of Cerastium pumilum and C. glutinosum in Central Europe. Preslia 84: 33-69. - fulltext pdf file
- Lososová Z., Chytrý M., Tichý L., Danihelka J., Fajmon K., Hájek O., Kintrová K., Kühn I., Láníková D., Otýpková Z. & Řehořek V. (2012): Native and alien floras in urban habitats: a comparison across 32 cities of central Europe. Global Ecology and Biogeography 21: 545-555. - fulltext in Wiley Online Library
- Lososová Z., Chytrý M., Tichý L., Danihelka J., Fajmon K., Hájek O., Kintrová K., Láníková D., Otýpková Z. & Řehořek V. (2012): Biotic homogenization of Central European urban floras depends on residence time of alien species and habitat types. Biological Conservation 145: 179-184.
- Marcussen T., Jakobsen K.S., Danihelka J., Ballard H.E., Blaxland K., Brysting A.K. & Oxelman B. (2012): Inferring species networks from gene trees in high-polyploid North American and Hawaiian violets (Viola, Violaceae). Systematic Biology 61: 107-126.
- Pyšek P., Danihelka J., Sádlo J., Chrtek J. Jr., Chytrý M., Jarošík V., Kaplan Z., Krahulec F., Moravcová L., Pergl J., Štajerová K. & Tichý L. (2012): Catalogue of alien plants of the Czech Republic (2nd edition): checklist update, taxonomic diversity and invasion patterns. Preslia 84: 155-255. - fulltext pdf file
- Roleček J., Čech L. & Danihelka J. (2012): Strošek polopásý (Lappula semicincta) v České republice. Zprávy České botanické společnosti 47: 1-10.
- Šarhanová P., Vašut R.J., Dančák M., Bureš P. & Trávníček B. (2012): New insights into the variability of reproduction modes in European populations of Rubus subgen. Rubus: how sexual are polyploid brambles? Sexual Plant Reproduction 25: 319-335.
- Šmarda P. & Bureš P. (2012): The variation of base composition in plant genomes. In: Wendel J., Greilhuber J., Doležel J. & Leitch IJ. [eds.]. Plant Genome Diversity. Vol. 1. Plant Genomes, their Residents, and their Evolutionary Dynamics. Heidelberg : Springer Verlag. Pp. 209-235.
- Šmarda P., Bureš P., Šmerda J. & Horová L. (2012): Measurements of genomic GC content in plant genomes with flow cytometry: a test for reliability. New Phytologist 193: 513-521.
- Veselý P., Bureš P., Šmarda P. & Pavlíček T. (2012): Genome Size and DNA base composition of Geophytes: the Mirror of Phenology and Ecology? Annals of Botany 109: 65-75.
- Vitek E., Danihelka J. & Adler W. (2012): Viola x palmata L. (Violaceae), nově zavlečený druh pro Rakousko a Evropu. Annalen des Naturhistorischen Museums in Wien B 113: 264-265.
- Vymyslicky T., Smarda P., Pelikan J., Cholastova T., Nedelnik J., Moravcova H., Pokorny R., Soldanova M. & Polakova M. (2012): Evaluation of the Czech core collection of Trifolium pratense, including morphological, molecular and phytopathological data. African Journal of Biotechnology 11: 3583-3595.
- Wagner V., Treiber J., Danihelka J., Ruprecht E., Wesche K. & Hensen I. (2012): Declining genetic diversity and increasing genetic isolation toward the range periphery of Stipa pennata, a Eurasian feather grass. International Journal of Plant Sciences 173: 802-811.
- Zedek F. & Bureš P. (2012): Evidence for Centromere Drive in the Holocentric Chromosomes of Caenorhabditis. PLoS ONE 7: e30496.
- Zedek F. & Bureš P. (2012): Evidence of centromere drive in the holocentric chromosomes of Caenorhabditis. PLoS ONE 7: e30496.
2011
- Ambrožová K., Mandáková T., Bureš P., Neumann P., Leitch I.J., Koblížková A., Macas J. & Lysák M. (2011): Diverse retrotransposon families and an AT-rich satellite DNA revealed in giant genomes of Fritillaria lilies. Annals of Botany 107: 255-268.
- Danihelka J. (2011): Digitaria ciliaris (Retz.) Koeler. In: Hadinec J. & Lustyk P. (eds). Additamenta ad floram Reipublicae Bohemicae. IX. Zprávy České Botanické Společnosti 46: 85-87.
- Danihelka J. (2011): Kruhatka Matthiolova (Cortusa matthioli) v Sudetech aneb anti-Hendrych. Zprávy České botanické společnosti 46: 251-263.
- Danihelka J. (2011): Znovu o rozrazilu pamětníkolistém, Veronica acinifolia. Zprávy České botanické společnosti Zprávy České botanické společnosti 46: 45-50. - fulltext in pdf
- Dítě D., Grulich V. & Eliáš P. (2011): Contributions to the distribution and ecology of Carex hordeistichos Vill. in the Czech Republic and Slovakia. Biodiversity: Research and Conservation 21: 55-62.
- Grulich V. (2011): Anthriscus nitida. Zprávy České botanické společnosti 45: 54-55.
- Grulich V. (2011): Arctium nemorosum. Zprávy České botanické společnosti 45: 55-56.
- Grulich V. (2011): Cichorium endivia. Zprávy České botanické společnosti 45: 71-72.
- Grulich V. (2011): Dianthus sylvaticus. Zprávy České botanické společnosti 45: 84-85.
- Grulich V. (2011): Senecio subalpinus. Zprávy České botanické společnosti 45: 144-146.
- Grulich V. (2011): Trifolium alexandrinum. Zprávy České botanické společnosti 45: 151-152.
- Grulich V. & P. Šiška (2011): Equisetum variegatum. Zprávy České botanické společnosti 45: 94-95.
- Grulich V. & Vydrová A. (2011): Corallorhiza trifida. Zprávy České botanické společnosti 45: 80-81.
- Grulich V. & Vydrová A. (2011): Symphytum tuberosum. Zprávy České botanické společnosti 45: 147-148.
- Kaplan Z., Štech M., Grulich V., Leugnerová G. & Pivoňková L. (2011): Utricularia bremii. Zprávy České botanické společnosti 45: 154-156.
- Lososová Z., Horsák M., Chytrý M., Čejka T., Danihelka J., Fajmon K., Hájek O., Juřičková L., Kintrová K., Láníková D., Otýpková Z., Řehořek V. & Tichý L. (2011): Diversity of Central European urban biota: effects of human-made habitat types on plants and land snails. Journal of Biogeography 38: 1152-1163. - fulltext in Wiley Online Library
- Pyšek P., Jarošík V., Chytrý M., Danihelka J., Kühn I., Pergl J., Tichý L., Biesmeijer J., Ellis W., Kunin W. & Settele J. (2011): Successful invaders co-opt pollinators of native flora and accumulate insect pollinators with increasing residence time. Ecological Monographs 81: 277-293. - fulltext on ESA website
- Rotreklová O., Bureš P., Řepka R., Grulich V., Šmarda P., Hralová I., Zedek F. & Koutecký T. (2011): Chromosome numbers of Carex. Preslia 83: 25-58. - fulltext pdf file
- Soják J., Danihelka J. & Hájek M. (2011): Potentilla turkestanica, a rare species new to the flora of Russia. Turczaninowia 14: 101-105. - fulltext in pdf
- Tichý L., Chytrý M. & Šmarda P. (2011): Evaluating the stability of the classification of community data. Ecography 34: 807-813. - fulltext in Wiley Online Library
- Vogel I. Zedek F. & Očenášek P. (2011): Constructing Phylogenetic Trees Based on Intra-Group Analysis of Human Mitochondrial DNA. In Lecture Notes in Computer Science. Berlin Heidelberg : Springer Verlag. Pp. 165-169.
2010
- Bureš P. (2010): Juncaginaceae Rich. - bařičkovité. In: Štěpánková et al. [eds]. Květena České republiky. Vol. 8. Academia, Praha. Pp. 324-328.
- Bureš P., Šmarda P., Rotreklová O., Oberreiter M., Burešová M., Konečný J., Knoll A., Fajmon K. & Šmerda J. (2010): Pollen viability and natural hybridization of Central European species of Cirsium. Preslia 82: 391-422.
- Danihelka J., van den Hof K., Jonsell B. & Marcussen T. (2010): Proposal to conserve the name Viola elatior against V. hornemanniana and V. stipulacea (Violaceae). Taxon 59: 1902-1903. - fulltext pdf file
- Danihelka J., van den Hof K. & Marcussen T. (2010): Viola montana and V. persicifolia (Violaceae): Two names to be rejected. Taxon 59: 1869-1878. - fulltext on Ingenta Content
- Grulich V. (2010): Botrychium lunaria. Zprávy České botanické společnosti 44: 200-201.
- Grulich V. (2010): Carex alba. Zprávy České botanické společnosti 44: 208-209.
- Grulich V. (2010): Gentianella praecox subsp. bohemica. Zprávy České botanické společnosti 44: 253-254.
- Grulich V. (2010): Typha shuttleworthii. Zprávy České botanické společnosti 44: 310-312.
- Grulich V. & Albrecht J. (2010): Filipendula vulgaris Mill. - tužebník obecný. Sborník Jihočeského muzea v Českých Budějovicích Přírodní vědy 50: 84-85.
- Grulich V., Janáková J. & Paulič R. (2010): Triglochin palustris L. - bařička bahenní. Sborník Jihočeského muzea v Českých Budějovicích Přírodní vědy 50: 89-90.
- Grulich V. & Koutecký P. (2010): Centaurea stenolepis. Zprávy České botanické společnosti 44: 218-219.
- Grulich V. & Vydrová A. (2010): Botrychium matricariifolium. Zprávy České botanické společnosti 44: 202-204.
- Grulich V. & Vydrová A. (2010): Coeloglossum viride. Zprávy České botanické společnosti 44: 224-225.
- Grulich V. & Vydrová A. (2010): Dianthus superbus subsp. superbus. Zprávy České botanické společnosti 44: 230-235.
- Grulich V. & Vydrová A. (2010): Malaxis monophyllos. Zprávy České botanické společnosti 44: 271-272.
- Hodálová I., Mereďa P., Vinikarová A., Grulich V. & Rotreklová O. (2010): A new cytotype of Jacobaea vulgaris (Asteraceae): frequency, morphology and origin. Nordic Journal of Botany 28: 413-427.
- Horsák M., Chytrý M., Pokryszko B.M., Danihelka J., Ermakov N., Hájek M., Hájková P., Kintrová K., Kočí M., Kubešová S., Lustyk P., Otýpková Z., Pelánková B. & Valachovič M. (2010): Habitats of relict terrestrial snails in southern Siberia: lessons for the reconstruction of palaeoenvironments of full-glacial Europe. Journal of Biogeography 37: 1450-1462. - fulltext in Wiley Online Library
- Hrouda L. & Grulich V. (2010): Iris L. In: Štěpánková et al. [eds]. Květena České republiky. Vol. 8. Academia, Praha. Pp. 565-581.
- Chytrý M., Danihelka J., Axmanová I., Božková J., Hettenbergerová E., Li C.-F., Rozbrojová Z., Sekulová L., Tichý L., Vymazalová M. & Zelený D. (2010): Floristic diversity of an eastern Mediterranean dwarf shrubland: the importance of soil pH. Journal of Vegetation Science 21: 1125-1137. - fulltext in Wiley Online Library
- Chytrý M., Danihelka J., Horsák M., Kočí M., Kubešová S., Lososová Z., Otýpková Z., Tichý L., Martynenko V.B. & Baisheva E.Z. (2010): Modern analogues from the Southern Urals provide insights into biodiversity change in the early Holocene forests of Central Europe. Journal of Biogeography 37: 767-780. - fulltext on Wiley InterScience
- Krahulcová A. & Rotreklová O. (2010): Use of flow cytometry in research on apomictic plants. Preslia 82: 23-39.
- Lepší M., Grulich V. & Ekrtová E. (2010): Carex tomentosa L. - ostřice plstnatá. Sborník Jihočeského muzea v Českých Budějovicích Přírodní vědy 50: 80-81.
- Nová J. & Danihelka J. (2010): Flóra a vegetace přírodních parků Kornatický potok a Kamínky jihovýchodně od Plzně. Erica 17: 3-32.
- Řehořek V. & Lososová Z. (2010): Gilia achilleifolia Benth. Zprávy České botanické společnosti 44: 262-263.
- Sharaf K., Horová L., Pavlíček T., Nevo E. & Bureš P. (2010): Genome size and base composition in Oryzaephilus surinamensis (Coleoptera: Sylvanidae) and differences between native (feral) and silo pest populations in Israel. Journal of Stored Products Research 46: 34-37.
- Šmarda P. & Bureš P. (2010): Understanding intraspecific variation in genome size in plants. Preslia 82: 41-61.
- Šmarda P., Horová L., Bureš P., Hralová I. & Marková M. (2010): Stabilizing selection on genome size in a population of Festuca pallens under conditions of intensive intraspecific competition. New Phytologist 187: 1195-1204.
- van den Hof K., Danihelka J., Marcussen T., Jonsell B., van den Berg R. & Gravendeel B. (2010): Proposals to reject the names Viola montana and V. persicifolia (Violaceae). Taxon 59: 1900-1902. - fulltext pdf file
- Vydrová A. & Grulich V. (2010): Cyperus michelianus. Zprávy České botanické společnosti 44: 229-230.
- Vydrová A. & Grulich V. (2010): Lekníny (rod Nymphaea) v jižních Čechách. Muzeum a současnost, ser. natur. 25: 25-71.
- Zedek F., Šmerda J., Šmarda P. & Bureš P. (2010): Correlated evolution of LTR retrotransposons and genome size in the genus Eleocharis. BMC Plant Biology 265: 1-10.
2009
- Danihelka J. (2009): Hordeum brevisubulatum (Trin.) Link. Zprávy České botanické společnosti 44: 267-268.
- Danihelka J., Niklfeld H. & Šípošová H. (2009): Viola elatior, V. pumila and V. stagnina in Austria, Czechia and Slovakia: a story of decline. Preslia 81: 151-171. - fulltext in pdf + appendix in pdf
- Danihelka J., Šmarda P. & Foggi B. (2009): Proposal to reject the name Festuca pannonica (Poaceae). Taxon 58: 295-296. - fulltext in pdf
- Dvořák D. (2009): Viola biflora L. Zprávy České botanické společnosti 44: 314-315.
- Eckstein R.L., Danihelka J. & Otte A. (2009): Variation in life-cycle between three rare and endangered floodplain violets in two regions: implications for population viability and conservation. Biologia 64: 69-80. - fulltext on SpringerLink
- Eliáš P., Dítě D., Grulich V. & Šuvada R. (2009): Occurrence of Camphorosma annua PALL. in Slovakia: past and present. Flora Pannonica 6:117-126.
- Grulich V. (2009): Výsledky floristického kursu České botanické společnosti v Šumperku (2.-10.7.1982). Zprávy České botanické společnosti, Příloha 209: 107-151.
- Grulich V., Králová T., Vydrová A. & Janderková J. (2009): Monitoring biotopů. In Härtel H., Lončáková J. & Hošek M. (eds) Mapování biotopů v České republice. Východiska, výsledky, perspektivy. Agentura ochrany přírody a krajiny ČR, Praha, pp. 83-84.
- Grulich V., Vydrová A. & Lustyk P. (2009): Hodnocení stavu habitatů z hlediska ochrany. In Härtel H., Lončáková J. & Hošek M. (eds) Mapování biotopů v České republice. Východiska, výsledky, perspektivy. Agentura ochrany přírody a krajiny ČR, Praha, pp. 29-59.
- Chytrý M., Láníková D., Lososová Z., Sádlo J., Otýpková Z., Kočí M., Petřík P., Šumberová K., Neuhäuslová Z., Hájková P., Hájek M., Králová Š., Karimová K., Danihelka J., Tichý L., Michalcová D., Hájek O. & Kubošová K. (2009): Vegetace České republiky 2. Ruderální, plevelová, skalní a suťová vegetace. Praha : Academia. 520 pp. - book in pdf
- Chytrý M., Wild J., Pyšek P., Tichý L., Danihelka J. & Knollová I. (2009): Maps of the level of invasion of the Czech Republic by alien plants. Preslia 81: 187-207. - fulltext in pdf
- Korenko S., Šmerda J. & Pekár S. (2009): Life-history of the parthenogenetic oonopid spider, Triaeris stenaspis (Araneae: Oonopidae). European Journal of Entomology 106: 217-223.
- Krahulcová A., Rotreklová O., Krahulec F., Rosenbaumová R. & Plačková I. (2009): Enrichning ploidy level diversity: the role of apomictic and sexual biotypes of Hieracium subgen. Pilosella (Asteraceae) that coexist in polyploid populations. Folia Geobotanica 44: 281-306. - fulltext on SpringerLink
- Lososová Z. & Grulich V. (2009): Chorological spectra of arable weed vegetation types in the Czech Republic. Phytocoenologia 39: 235-252. - fulltext on IngentaConnect
- Lososová Z., Otýpková Z., Danihelka J. & Láníková D. (2009): Diverzita květeny středoevropských velkoměst. Veronica 23: 6-9.
- Pyšek P., Jarošík V., Pergl J., Randall R., Chytrý M., Kühn I., Tichý L., Danihelka J., Chrtek J. & Sádlo J. (2009): The global invasion success of Central European plants is related to distribution characteristics in their native range and species traits. Diversity and Distributions 15: 891-903. - fulltext on Wiley InterScience
- Rotreklová O. & Řehořek V. (2009): Amsinckia lycopsoides (Lehm.) Lehm. Zprávy České botanické společnosti 44: 195-196.
- Rotreklová O. & Řehořek V. (2009): Ferulago confusa Velen. Zprávy České botanické společnosti 44: 245-247.
- Řehořek V., Danihelka J., Chytrý M., Láníková D. & Lososová Z. (2009): Stachys setifera C. A. Mey. Zprávy České botanické společnosti 44: 304-305.
- Šmarda P., Danihelka J. & Foggi B. (2009): Taxonomic and nomenclatural notes on Festuca pannonica, F. valesiaca and F. pseudodalmatica (Poaceae). Taxon 58: 271-276. - fulltext on IngentaConntect
- Vydrová A. & Grulich V. (2009): Výsledky mapování biotopů jako podklad pro optimalizaci sítě maloplošných chráněných území. In Härtel H., Lončáková J. & Hošek M. (eds) Mapování biotopů v České republice. Východiska, výsledky, perspektivy. Agentura ochrany přírody a krajiny ČR, Praha, pp. 71-78.
- Vydrová A., Grulich V., Ekrt L. & Ekrtová E. (2009): Řídká blana u Zahájí na Českobudějovicku - významná lokalita vodní a mokřadní flóry a vegetace. Muzeum a současnost, ser. natur. 24: 27-54.
2008
- Apostolova I., Petrova A.S., Meshinev T. & Danihelka J. (2008): Stipa ucrainica (Poaceae): A recently recognized native species of the Bulgarian flora. Phytologia Balcanica 14: 257-262. - fulltext in pdf
- Bureš P. & Danihelka J. (2008): Eleocharis palustris subsp. waltersii, a new name for E. palustris subsp. vulgaris. Preslia 80: 225-228.
- Bureš P., Danihelka J., Husáková M. & Pařil P. (2008): Psárky Alopecurus aequalis a A. geniculatus v České republice: jejich určování a rozšíření. Muzeum a současnost, ser. natur. 23: 3-61. - fulltext in pdf
- Danihelka J. (2008): Hvězdnice sivá Aster canus, Christian Ferdinand Hochstetter and two less known sources of information on the flora of Moravia. Zprávy České botanické společnosti 43: 1-16. - fulltext in pdf
- Danihelka J. & Ehrendorfer F. (2008): Proposal to conserve the name Achillea pannonica against A. seidlii (Asteraceae). Taxon 57: 1356-1357.
- Eliáš P., Dítě D., Grulich V. & Sádovský M. (2008): Distribution and communities of Crypsis aculeata and Heleochloa schoenoides in Slovakia. Hacquetia 7: 5-20.
- Fajmon K. (2008): Tetragonia tetragonoides (Pallas) O. Kuntze. In: Hadinec J. & Lustyk P. (eds). Additamenta ad floram Reipublicae Bohemicae. VII. Zprávy České Botanické Společnosti 43: 324-325. - fulltext in pdf
- Fajmon K. (2008): Viola suavis M. Bieb. In: Hadinec J. & Lustyk P. (eds). Additamenta ad floram Reipublicae Bohemicae. VII. Zprávy České Botanické Společnosti 43: 331-332. - fulltext in pdf
- Fajmon K. (2008): Sclerochloa dura (L.) P. Beauv. Zprávy České botanické společnosti 43: 312-313.
- Fajmon K. (2008): Viola suavis M. Bieb. Zprávy České botanické společnosti 43: 331-333.
- Fajmon K. & Danihelka J. (2008): Bromus commutatus Schrader. In: Hadinec J. & Lustyk P. (eds). Additamenta ad floram Reipublicae Bohemicae. VII. Zprávy České Botanické Společnosti 43: 260-262. - fulltext in pdf
- Fajmon K., Danihelka J. & Lososová Z. (2008): Amaranthus deflexus L. In: Hadinec J. & Lustyk P. (eds). Additamenta ad floram Reipublicae Bohemicae. VII. Zprávy České Botanické Společnosti 43: 256-258. - fulltext in pdf
- Fajmon K., Danihelka J., Lososová Z., Sutorý K., Řepka R. & Dvořák D. (2008): Geranium sibiricum L. In: Hadinec J. & Lustyk P. (eds). Additamenta ad floram Reipublicae Bohemicae. VII. Zprávy České Botanické Společnosti 43: 281-283. - fulltext in pdf
- Fajmon K. & Simonová D. (2008): Merlíky, opomíjení průvodci našich cest. Živa 2008: 205-207. - fulltext in pdf
- Grulich V. (2008): Fytogeografie [Phytogeography]. In: Jongepierová I. (ed.). Louky Bílých Karpat [Grasslands of the White Carpathians Mountains]. Veselí nad Moravou, ZO ČSOP Bílé Karpaty. pp. 81-88.
- Hodálová I., Mereďa P.jr., Mártonfi P., Mártonfiová L. & Danihelka J. (2008): Morphological characters useful for the delimitation of taxa within Viola subsect. Viola (Violaceae): A morphometric study from the West Carpathians. Folia Geobotanica 43: 83-117.
- Chytrý M., Danihelka J., Kubešová S., Lustyk P., Ermakov N., Hájek M., Hájková P., Kočí M., Otýpková Z., Roleček J., Řezníčková M., Šmarda P., Valachovič M., Popov D. & Pišút I. (2008): Diversity of forest vegetation across a strong gradient of climatic continentality: Western Sayan Mountains, southern Siberia. Plant Ecology 196: 61-83. - fulltext on SpringerLink
- Chytrý M. & Grulich V. (2008): Podyjí National Park: Botanical excursion guide. 17th International workshop European Vegetation Survey. Using phytosociological data to address ecological questions. 1-5 May 2008. Masaryk University, Brno, Czech Republic. Abstracts and Excursion Guides. Masaryk University, Brno. Pp. 189-211. - fulltext in pdf
- Chytrý M., Jarošík V., Pyšek P., Hájek O., Knollová I., Tichý L. & Danihelka J. (2008): Separating habitat invasibility by alien plants from the actual level of invasion. Ecology 89: 1541-1553. - fulltext pdf file
- Jongepierová I. & Fajmon K. [eds] (2008): Výzkum obnovy travních porostů [Grassland restoration]. In: Jongepierová I. (ed.). Louky Bílých Karpat [Grasslands of the White Carpathians Mountains]. Veselí nad Moravou, ZO ČSOP Bílé Karpaty. pp. 383-423.
- Jongepierová I., Jongepier J., Devánová K., Fajmon K., Hájek M. & Škodová I. (2008): Vybrané vzácné rostliny [Selected rare plant species]. In: Jongepierová I. (ed.). Louky Bílých Karpat [Grasslands of the White Carpathians Mountains], Veselí nad Moravou, ZO ČSOP Bílé Karpat. pp. 101-127.
- Kučera P., Grulich V., Fránková M. & Bureš P. (2008): Distribution of freshwater red algal family Lemaneaceae (Rhodophyta) in the Czech Republic: an update. Fottea 8: 125-128.
- Mackovčin P., Jatiová M., Slavík P., Demek J., Grulich V., Hort L., Hudec K., Kříž H., Laštůvka Z., Petruš J., Plánka L., Sedláček M. & Unar J. (2008): Brněnsko. In Chráněná území ČR, sv. 9. Praha : Agentura ochrany přírody a krajiny ČR a EkoCentrum Brno.
- Pavlíček T., Bureš P., Horová L., Raskina O. & Nevo E. (2008): Genome size microscale divergence of Cyclamen persicum in Evolution canyon, Israel. Central European Journal of Biology 3: 83-90.
- Rotreklová O. (2008): Hieracium subgen. Pilosella : pollen stainability in sexual, apomictic and sterile plants. Biologia 63: 63-66. - fulltext on SpringerLink
- Sharaf K., Bureš P., Horová L., Pavlíček T. & Nevo E. (2008): Distribution of abundance and genome size variability in the grain beetle Oryzaephilus surinamensis (Linnaeus, 1758) (Coleoptera: Silvanidae). Zoology in the Middle East, Heidelberg 45: 79-89.
- Sychra J., Danihelka J., Heralt P., Horal D., Horsák M., Chytil J., Kubíček F., Květ J., Macháček P., Přikryl I. & Roleček J. (2008): Letnění rybníka Nesyt v roce 2007. Živa 4: 189-192.
- Šmarda P. (2008): DNA ploidy level variability of some fescues (Festuca subg. Festuca, Poaceae) from Central and Southern Europe measured in fresh plants and herbarium specimens. Biologia 63: 349-367.
- Šmarda P., Bureš P., Horová L., Foggi B. & Rossi G. (2008): Genome size and GC content evolution of Festuca: ancestral expansion and subsequent reduction. Annals of Botany 101: 421-433. - pdf on OxfordJournals
- Šmarda P., Bureš P., Horová L. & Rotreklová O. (2008): Intrapopulation genome size dynamics in Festuca pallens. Annals of Botany 102: 599-607. - fulltext on Oxford journals
2007
- Bravencová L., Grulich V., Musil Z., Reiter A., Reiterová L. & Táborská J. (2007): Významné nálezy cévnatých rostlinna území Národního parku Podyjí od roku 1995. Thayensia 7: 85-119.
- Bureš P. (2007): Revision of caryological data to the genera Cirsium, Eleocharis, Milium, Schoenoplectus, and Triglochin. In Marhold K., Mártonfi P., Mereďa P. jun. & Mráz P. (eds.): Chromosome number survey of the ferns and flowering plants of Slovakia. Bratislava: Veda, 2007, pp. 195-594.
- Čížek L., Roleček J. & Danihelka J. (2007): Celoplošná příprava půdy v lesích a její důsledky pro biodiverzitu. Živa 2007: 266-268. - fulltext in pdf
- Danihelka J. (2007): Cirsium brachycephalum Juratzka. Zprávy České botanické společnosti 42: 270-271.
- Danihelka J. (2007): Revision of caryological data to the genus Achillea. In Marhold K., Mártonfi P., Mereďa P. jun. & Mráz P. (eds.): Chromosome number survey of the ferns and flowering plants of Slovakia. Bratislava: Veda, 2007, pp. 68-72.
- Fajmon K. (2007): Stellaria pallida (Dumort.) Crép. Zprávy České botanické společnosti 42: 329-332.
- Grulich V. (2007): Revision of caryological data to the genera Armeria, Arrhenatherum, Artemisia, Bistorta, Blysmus, Calamagrostis, Camphorosma, Carex, Catabrosa, Cladium, Cleistogenes, Corispermum, Corynephorus, Crypsis, Cynodon, Cynosurus, and Cyperus. In Marhold K., Mártonfi P., Mereďa P. jun. & Mráz P. (eds.): Chromosome number survey of the ferns and flowering plants of Slovakia. Bratislava: Veda, 2007, pp. 109-220.
- Grulich V. (2007): Revision of caryological data to the genera Drosera, Echinochloa, Elytrigia, Eragrostis, Eriophorum, Fallopia, Isolepis, Laserpitium, Limonium, Lolium, Nardus, and Oxyria. In Marhold K., Mártonfi P., Mereďa P. jun. & Mráz P. (eds.): Chromosome number survey of the ferns and flowering plants of Slovakia. Bratislava: Veda, 2007, pp. 234-425.
- Grulich V. (2007): Revision of caryological data to the genera Peucedanum, Phalaris, Pholiurus, Podospermum, Polygonum, Rhynchospora, Schoenus, Scirpoides, Scirpus, Scorzonera, Sorghum, Thesium, Tragus, Trichophorum, and Vulpia. In Marhold K., Mártonfi P., Mereďa P. jun. & Mráz P. (eds.): Chromosome number survey of the ferns and flowering plants of Slovakia. Bratislava: Veda, 2007, pp. 432-629.
- Hodálová I., Grulich V., Horová L., Valachovič M. & Marhold K. (2007): Occurence of tetraploid and octoploid cytotypes in Senecio jacobaea ssp. jacobaea (Asteraceae) in Pannonia and the Carpathians. Botanical Journal of the Linnean Society 153: 231-242.
- Holt J. A., Stoneberg Holt S. D. & Bureš P. (2007): Experimental design in intraspecific organelle DNA sequence studies III: statistical measures of sampling success. Taxon 56: 847-856.
- Houzar S., Reiter A., Grulich V., Šmarda P., Křivan V., Prášek V., Hanuš M. & Hanák V. (2007): Geologické, botanické a zoologické zajímavosti Moravskobudějovicka a Jemnicka. Moravské Budějovice, 94 pp.
- Chytrý M., Danihelka J., Ermakov N., Hájek M., Hájková P., Kočí M., Kubešová S., Lustyk P., Otýpková Z., Popov D., Roleček J., Řezníčková M., Šmarda P. & Valachovič M. (2007): Plant species richness in continental southern Siberia: effects of pH and climate in the context of the species pool hypothesis. Global Ecology and Biogeography 16: 668-678. - fulltext on Blackwell Synergy
- Jongepier J.W., Fajmon K. & Otýpková Z. (2007): Významné nálezy cévnatých rostlin v CHráněné krajinné oblasti Bílé Karpaty a v přilehlém okolí: nové druhy pro území. Zprávy České botanické společnosti 42: 117-135.
- Lysák M.A., Cheung K, Kitschke M. & Bureš P. (2007): Ancestral chromosomal blocks are triplicated in brassiceae species with varying chromosome number and genome size. Plant Physiology 145: 402-410.
- Marhold K., Nieto Feliner G., Vickery R.K., Miller M., Lihová J., Kučera J., Hodálová I., Vinikarová A., Grulich V., Mereďa P. & Horová L. (2007): IAPT/IOPB chromosome data 4. Taxon 56: 1269.
- Rotreklová O. (2007): New record in Eleocharis. In Marhold K., Mártonfi P., Mereďa P. jun. & Mráz P. (eds.): Chromosome number survey of the ferns and flowering plants of Slovakia. Bratislava: Veda, 2007, p. 237.
- Stoneberg Holt S. D., Horová L. & Bureš P. (2007): Experimental design in intraspecific organelle DNA sequence studies II: Haplotype detection by Chemical Cleavage of Mismatch (CCM) using SYBR Green II staining. Taxon 56: 509-515.
- Stoneberg Holt S.D. & Bureš P. (2007): Experimental design in intraspecific organelle DNA sequence studies I: haplotype detection methods. Taxon 56: 137-144.
- Šmarda P., Bureš P. & Horová L. (2007): Random Distribution Pattern and Non-adaptivity of Genome Size in a Highly Variable Population of Festuca pallens. Annals of Botany 100: 141-150. - fulltext on OxfordJournals
- Šmarda P. & Grulich V. (2007): Revision of caryological data to the genus Festuca. In Marhold K., Mártonfi P., Mereďa P. jun. & Mráz P. (eds.): Chromosome number survey of the ferns and flowering plants of Slovakia. Bratislava: Veda, 2007, pp. 259-267.
- Šmarda P., Šmerda J., Knoll A., Bureš P. & Danihelka J. (2007): Revision of Central European taxa of Festuca ser. Psammophilae Pawlus: morphometrical, karyological and AFLP analysis. Plant Systematics and Evolution 266: 197-232. - fulltext on SpringerLink
2006
- Danihelka J. (2006): Ein Blick über die Grenze - Tschechische Salzstandorte und ihre Vegetation. In: Oberleitner I., Wolfram G. & Achatz-Blab A. (eds.), Salzlebensräume in Österreich. Umweltbundesamt, Wien, pp. 119-120.
- Danihelka J., Saukel J. & Ehrendorfer F. (2006): Typification of the names Achillea millefolium var. collina and A. pannonica (Asteraceae, Anthemideae). Taxon 55: 507-510.
- Eckstein R.L., Hölzel N. & Danihelka J. (2006): Biological Flora of Central Europe: Viola elatior, V. pumila and V. stagnina. Perspectives in Plant Ecology, Evolution and Systematics 8: 45-66. - fulltext in pdf
- Eckstein R.L., O'Neill R.A., Danihelka J., Otte A. & Köhler W. (2006): Genetic structure among and within peripheral and central populations of three endangered floodplain violets. Molecular Ecology 15: 2367-2379. - fulltext pdf file
- Grulich V. (2006): Poznámky k vegetaci jedlin v jižních Čechách. In Kučera T. & Navrátilová J. (eds.), Biotopy a jejich vegetační interpretace v ČR. Česká botanická společnost, Praha, pp. 107-118.
- Kochjarová J., Valachovič M., Bureš P. & Mráz P. (2006): The genus Cochlearia L. (Brassicaceae) in the Eastern Carpathians and adjacent area. Botanical Journal of the Linnean Society 151: 355-364.
- Kučera P. (2006): Za tajemstvím našich sladkovodních ruduch. Živa 2006: 13-14.
- Kučera P., Uher B. & Komárek O. (2006): Epiphytic cyanophytes Xenococcus kerneri and Chamaesiphon minutus on the freshwater red alga Paralemanea catenata (Rhodophyta). Biologia 61: 1-3. - fulltext pdf file
- Šmarda P. (2006): DNA ploidy levels and intraspecific DNA content variability in Romanian fescues (Festuca, Poaceae) measured in fresh and herbarium material. Folia Geobotanica 41: 417-432. - fulltext pdf file
- Šmarda P. & Bureš P. (2006): Intraspecific DNA content variability in Festuca pallens on different geographical scales and ploidy levels. Annals of Botany 98: 665-678. - fulltext on AOB
- Šmarda P. & Stančík D. (2006): Ploidy level variability in south american fescues (Festuca L., Poaceae): Use of flow cytometry in up to 5 1/2-year-old caryopses and herbarium specimen. Plant Biology 8: 73-80.
- Šmerda J., Sedláček I., Páčová Z., Krejčí E. & Havel L. (2006): Paenibacillus sepulcri sp. nov., isolated from biodeteriorated mural paintings in the Servilia tomb. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 56: 2341-2344.
- Vydrová A., Kuchařová P. & Grulich V. (2006): Optimalizace sítě maloplošných zvláště chráněných území. Východočeské muzeum Pardubice a Agentura ochrany přírody a krajiny Pardubice, Práce a Studie, Supplementum 1/2006, 218 pp.
2005
- Culek M., Buček A., Grulich V., Hartl P. Hrabica A., Kocián J., Kyjovský Š. & Lacina J. (2005): Biogeografické členění České republiky. II. díl. Agentura ochrany přírody a krajiny ČR, Praha, 589 pp.
- Chytrý M., Pyšek P., Tichý L., Knollová I. & Danihelka J. (2005): Invasions by alien plants in the Czech Republic: a quantitative assessment across habitats. Preslia 77: 339-354. - fulltext pdf file
- Kučera P. & Komárek O. (2005): Biomass quantification of epiphytic freshwater rhodophyte Audouinella pygmaea Kützing. Algological Studies 115: 145-157. - fulltext pdf file
- Rotreklová O., Krahulcová A., Mráz P., Mrázová V., Mártonfiová L., Peckert T. & Singliarová B. (2005): Chromosome numbers and breeding systems of some European species of Hieracium subgen. Pilosella. Preslia 77: 177-195. - fulltext in pdf
- Řepka R. & Danihelka J. (2005): Typification of the name Carex muricata var. lamprocarpa Wallr. and its nomenclatural consequences. Preslia 77: 129-136.
- Stoneberg Holt S. D., Horová L., Bureš P., Janeček J. & Černoch V. (2005): The trnL-F plastid DNA characters of three Poa pratensis (Kentucky bluegrass) varieties. Plant, Soil and Environment 51: 94-99.
- Šmarda P. & Kočí K. (2005): Festuca alpina, a new species for the flora of Slovakia. Biologia 60: 383-385.
- Šmarda P., Müller J., Vrána J. & Kočí K. (2005): Ploidy level variability of some Central European fescues (Festuca subg. Festuca L., Poaceae). Biologia 60: 25-36. - fulltext in pdf
- Šmerda J., Sedláček I., Páčová Z., Durnová E., Smíšková A. & Havel L. (2005): Paenibacillus mendelii sp. nov., a bacterium from surface-sterilized seeds of Pisum sativum L. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 55: 2351-2354.
- Uher B., Kováčik Ľ., Kučera P., Hindáková A. & Pivko D. (2005): Cyanobaktérie a riasy na kamenných subtrátoch objektov kultúrnohistorického významu v Bratislave. Bulletin Slovenskej botanickej spoločnosti 27: 11-16. - fulltext in pdf